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巴西橡胶树PEPRK基因家族成员的鉴定和表达分析
引用本文:肖小虎,隋金蕾,戚继艳,方永军,周斌辉,唐朝荣.巴西橡胶树PEPRK基因家族成员的鉴定和表达分析[J].热带作物学报,2017(1):70-75.
作者姓名:肖小虎  隋金蕾  戚继艳  方永军  周斌辉  唐朝荣
作者单位:1. 中国热带农业科学院橡胶研究所,海南儋州,571737;2. 中国热带农业科学院橡胶研究所,海南儋州 571737;海南大学农学院,海南海口 570228
基金项目:国家自然科学基金项目(31400565)
摘    要:PEP羧化酶激酶相关激酶(PEP carboxylase kinase-related kinases,PEPRKs)是CDPK-Sn RK超家族的一员,目前对其生理功能尚不清楚。本研究以拟南芥和杨树的PEPRK序列作为探针,对橡胶树和其他5种植物(木薯、水稻、杨树、蓖麻和拟南芥)的基因组和转录组数据进行全面搜索,共鉴定得到25个PEPRK基因家族成员,其中包括5个橡胶树PEPRK基因,命名为Hb PEPRK1-5。序列分析发现橡胶树PEPRK和其他植物类似,在序列中部含有一个相对比较保守的激酶结构域,而两端的同源性相对较低。在基因结构和进化方面,PEPRK主要分为2个大的分支,相同分支的成员在结构域和内含子分布上更为相似,其中橡胶树和木薯PEPRK在进化上具有较近的亲缘关系。在基因的表达方面,Hb PEPRK1主要在稳定期的叶片中表达,Hb PEPRK2和Hb PEPRK5在树叶、树皮和胶乳中均有表达,Hb PEPRK4主要在种子中表达;另外,研究发现橡胶树PEPRK家族成员的表达还与叶片发育、乙烯利刺激、真菌侵染和低温胁迫具有一定的相关性。

关 键 词:巴西橡胶树  PEPRK  基因家族  结构与进化  表达分析

Identification and Expression of PEPRK Genes from Hevea brasliensis
XIAO Xiaohu,SUI Jinlei,QI Jiyan,FANG Yongjun,ZHOU Binhui,TANG Chaorong.Identification and Expression of PEPRK Genes from Hevea brasliensis[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2017(1):70-75.
Authors:XIAO Xiaohu  SUI Jinlei  QI Jiyan  FANG Yongjun  ZHOU Binhui  TANG Chaorong
Abstract:
Keywords:Hevea brasiliensis  PEPRK  gene family  structure and evolution  expression analysis
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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