| 药用植物金银花Dof基因家族的筛选及表达分析 |
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| 引用本文： | 乔永刚,陈亮,王勇飞,崔芬芬,曹亚萍,贺嘉欣,贾孟君,宋芸.药用植物金银花Dof基因家族的筛选及表达分析[J].核农学报,2020,34(9):1889-1897. |
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| 作者姓名： | 乔永刚 陈亮 王勇飞 崔芬芬 曹亚萍 贺嘉欣 贾孟君 宋芸 |
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| 作者单位： | 山西农业大学生命科学学院,山西 太谷 030801 |
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| 摘 要： | Dof(DNA-binding one zinc finger)蛋白是一类植物所特有的转录因子,N-末端具有高度保守的C2-C2单锌指结构域,C-末端的转录调控区的氨基酸具有高度多样性,其在植物光合、细胞周期及逆境响应等过程中发挥着重要的作用。本研究基于金银花测序数据,利用生物信息学的方法筛选了候选的LjDof基因,并对其理化性质、亚细胞定位、同源序列比对、保守基序、系统进化发育和表达模式进行了深入分析。结果表明,金银花Dof转录因子家族包含11个基因,编码的氨基酸的个数为157~492,理论等电点为5.45~9.48,均为不稳定亲水性蛋白。亚细胞定位显示,LjDof基因都在细胞核中有定位,个别在其他部位也有定位。同源比对和Motif分析发现,11个LjDof基因都含有完整的C2-C2单锌指结构。系统进化发育分析表明,金银花Dof蛋白分为五个亚类。实时荧光定量PCR及表达模式分析表明,LjDof基因在金银花低温胁迫不同时间下有着不同的表达规律。本研究结果为进一步研究金银花Dof基因在逆境胁迫下的功能提供了理论基础。
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| 关 键 词： | 金银花 Dof 生物信息学分析 表达分析 |
| 收稿时间： | 2019-02-19 |
Screening and Analysis of Dof Gene Family in Medicinal Plant Lonicera japonica Thunb. |
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| QIAO Yonggang,CHEN Liang,WANG Yongfei,CUI Fenfen,CAO Yaping,HE Jiaxin,JIA Mengjun,SONG Yun.Screening and Analysis of Dof Gene Family in Medicinal Plant Lonicera japonica Thunb.[J].Acta Agriculturae Nucleatae Sinica,2020,34(9):1889-1897. |
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| Authors: | QIAO Yonggang CHEN Liang WANG Yongfei CUI Fenfen CAO Yaping HE Jiaxin JIA Mengjun SONG Yun |
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| Institution: | College of Life Sciences, Shanxi Agricultural University, Taigu, Shanxi 030801 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Lonicera japonica Thunb Dof bioinformatics analysis expression analysis |
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