| 基于SSR标记的朝天椒种质遗传多样性分析 |
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| 引用本文： | 张曼,任佳佳,王钦,安朝龙,吴培云,谢龙安,李伟.基于SSR标记的朝天椒种质遗传多样性分析[J].河南农业科学,2020,49(7):101-109. |
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| 作者姓名： | 张曼 任佳佳 王钦 安朝龙 吴培云 谢龙安 李伟 |
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| 作者单位： | 贵州大学 农学院,贵州 贵阳 550025;毕节职业技术学院,贵州 毕节 551700 |
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| 基金项目： | 一流学科建设项目;国家科技支撑计划;贵州省科技厅农业科技攻关计划;国家自然科学基金;贵州大学博士基金 |
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| 摘 要： | 探究以贵州为主的西南地区朝天椒种质遗传多样性,为朝天椒种质的保续、利用与分子标记辅助选择提供准确参考依据。利用20个SSR(简单串联重复序列)分子标记,对112份西南地区朝天椒种质资源进行遗传多样性分析。结果表明,20对SSR引物共检测出65个等位变异,每对引物的等位变异为2～4个,平均每对引物3.25个等位变异,平均有效等位基因数为1.829 4,平均多态性信息量(PIC)为0.544 0,平均Shannon’s信息指数(I)为0.723 4,观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、Nei’s期望杂合度的平均值分别为0.492 0、0.433 7、0.431 8,所筛选出的20对SSR引物多态性较高,能较好地反映朝天椒不同地方种间的遗传多样性信息。聚类结果表明,供试材料居群间遗传相似系数(GS)值为0.569 2～0.953 8,平均值为0.773 3,朝天椒种质间的遗传相似性相对较高,材料间的亲缘关系比较接近。在GS值0.767 0处将供试材料分为4类,显示出112份朝天椒材料总体情况与地理分布有一定关联,但也存在区域间和省内外间的互相渗透,每个类别均聚集了不同地理来源的种质。
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| 关 键 词： | 朝天椒 种质资源 SSR标记 遗传多样性 亲缘关系 |
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