| 牛SLC13家族基因编码蛋白的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 黄明捷,张勇,陈祥,陈伟,莫先艇,郭勇,王天松.牛SLC13家族基因编码蛋白的生物信息学分析[J].河南农业科学,2020,49(3):157-166. |
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| 作者姓名： | 黄明捷 张勇 陈祥 陈伟 莫先艇 郭勇 王天松 |
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| 作者单位： | 贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳 550025;贵州大学贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵州贵阳 550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳 550025;贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳 550025;贵州大学贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵州贵阳 550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳 550025;贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳 550025;贵州大学贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵州贵阳 550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳 550025;贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳 550025;贵州大学贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵州贵阳 550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳 550025;贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳 550025;贵州大学贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵州贵阳 550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳 550025;贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳 550025;贵州大学贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵州贵阳 550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳 550025;贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳 550025;贵州大学贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵州贵阳 550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳 550025 |
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| 基金项目： | 贵州省农业领域重点项目 |
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| 摘 要： | 为研究牛溶质载体13(SLC13)基因编码蛋白的结构和功能,运用生物信息学软件对牛SLC13蛋白的理化性质、疏水性、二级结构及三级结构、序列保守基序、亚细胞定位、跨膜区进行分析,预测其蛋白质互作网络并构建不同物种SLC13基因家族编码蛋白的系统发育树。结果表明,牛SLC13蛋白的氨基酸数介于520～626个,亮氨酸含量最高,组氨酸含量最低,分子质量介于57.80～68.96 ku,其编码蛋白均为疏水性蛋白,除SLC13A2蛋白外的4个编码蛋白均为稳定蛋白。牛SLC13蛋白的二级结构主要由α-螺旋、β-转角以及无规卷曲组成,外显子数目介于11～16,除SLC13A3基因编码蛋白无Motif 10、SLC13A5基因编码蛋白无Motif 8外,其他编码蛋白序列均存在Motif 1—10,SLC13蛋白亚细胞定位于质膜、内质网和线粒体,SLC13A3蛋白在高尔基体中有少量分布。牛SLC13蛋白均为多次跨膜螺旋的内在膜蛋白,其以不同形式在生物学层面和分子功能层面发挥功能。系统进化分析发现,14个物种的SLC13A1、SLC13A4蛋白处于同一个较大分支,SLC13A2、SLC13A3和SLC13A5处于另一个较大分支,普通牛均与瘤牛、水牛、牦牛亲缘关系最近。
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| 关 键 词： | 牛SLC13基因家族 柠檬酸循环中间体 生物信息学分析 进化树 蛋白质互作 |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
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