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芝麻抗裂蒴基因SiIND1的克隆与原核表达
引用本文:刘艳阳,武轲,梅鸿献,杜振伟,崔承齐,江晓林,郑永战.芝麻抗裂蒴基因SiIND1的克隆与原核表达[J].河南农业科学,2020,49(5):63-68.
作者姓名:刘艳阳  武轲  梅鸿献  杜振伟  崔承齐  江晓林  郑永战
作者单位:河南省农业科学院芝麻研究中心,河南郑州 450002;河南省农业科学院芝麻研究中心,河南郑州 450002;河南省农业科学院芝麻研究中心,河南郑州 450002;河南省农业科学院芝麻研究中心,河南郑州 450002;河南省农业科学院芝麻研究中心,河南郑州 450002;河南省农业科学院芝麻研究中心,河南郑州 450002;河南省农业科学院芝麻研究中心,河南郑州 450002
基金项目:国家特色油料产业技术体系项目;河南省农科院优秀青年科技基金;国家自然科学基金
摘    要:LOC105167765基因属于KANADI(KAN)基因家族,与芝麻裂蒴性有关。从芝麻裂蒴品种豫芝11号和抗裂蒴品种郑芝InD01中分别克隆得到LOC105167765基因cDNA序列SiIND1,并进行序列生物信息学分析和原核表达分析。结果表明,豫芝11号SiIND1基因cDNA序列全长为1 320 bp,编码439个氨基酸,推测的蛋白质分子质量为50.0 ku,等电点7.53,编码SHAQKYF类MYB家族的转录因子,具有GARP保守结构域,属于KAN家族。郑芝InD01 SiIND1基因cDNA序列长度为1 246 bp,包括1个最大的开放阅读框900 bp,编码299个氨基酸,推测的蛋白质分子质量为32.9 ku,等电点8.37,GARP结构域发生缺失突变,翻译提前终止,可能导致基因功能丧失。将SiIND1连接到原核表达载体pET30a,并转化大肠杆菌BL21,通过IPTG诱导和SDS-PAGE电泳检测,表达的融合蛋白与预测蛋白大小相符合,进一步证实了抗裂蒴品种和裂蒴品种SiIND1基因的蛋白质表达存在差异,抗裂蒴材料SiIND1基因在翻译过程中发生提前终止。

关 键 词:芝麻  抗裂蒴基因  基因克隆  生物信息学分析  原核表达
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