| 帚状江蓠质体UPA和线粒体COⅠ基因的序列比较及其系统进化分析 |
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| 引用本文： | 徐瑞,陈素文,段亚飞,张文文,王珺,周传朋,王芸.帚状江蓠质体UPA和线粒体COⅠ基因的序列比较及其系统进化分析[J].海洋渔业,2023(3):302-313. |
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| 作者姓名： | 徐瑞 陈素文 段亚飞 张文文 王珺 周传朋 王芸 |
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| 作者单位： | 1. 上海海洋大学水产与生命学院;2. 中国水产科学研究院南海水产研究所,农业农村部水产品加工重点实验室 |
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| 基金项目： | 广东省自然科学基金(2019A1515012159)；;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2020KX03)； |
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| 摘 要： | 为研究海南省帚状江蓠(Gracilaria edulis)野生群体的种质资源、遗传多样性状况及红藻门物种间亲缘关系，采集海南省文昌和莺歌海潮间带的野生帚状江蓠，采用PCR扩增获得帚状江蓠质体UPA基因片段(质体23S rRNA V区域)和线粒体COⅠ基因片段，分别对其进行序列比较及系统进化分析。结果表明，UPA基因片段T、C、A、G的含量分别为26.2%、16.2%、30.3%、27.3%;COⅠ基因片段T、C、A、G的含量分别为39.2%、15.1%、27.6%、18.1%;UPA和COⅠ基因片段的A+T的平均含量分别为56.5%和66.8%。UPA基因片段长度为370 bp,共检测出1种单倍型，无多态性位点；COⅠ基因片段长度为664 bp,共检测出2种单倍型，3个多态性位点，均为简约信息位点。与UPA基因相比，COⅠ基因具有更高的变异度，更适合用于帚状江蓠遗传多样性的分析。基于UPA和COⅠ基因片段对帚状江蓠进行系统进化分析，两者结果一致，结合形态学分析表明，帚状江蓠应是江蓠属内独立的分支。
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| 关 键 词： | 帚状江蓠 UPA基因 COⅠ基因 序列分析 系统进化分析 |
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