| 水禽细小病毒选择压力与基因重组分析 |
| |
| 引用本文： | 汪宏才,商雨,郭云清,曾哲,张蓉蓉,温国元,罗青平.水禽细小病毒选择压力与基因重组分析[J].湖北农业科学,2023(11):191-197. |
| |
| 作者姓名： | 汪宏才 商雨 郭云清 曾哲 张蓉蓉 温国元 罗青平 |
| |
| 作者单位： | 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所/农业农村部畜禽细菌病防治制剂创制重点实验室/动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室 |
| |
| 基金项目： | 国家现代农业产业技术体系专项资金项目（CARS-41-G13）； |
| |
| 摘 要： | 通过对临床水禽细小病毒进行PCR检测、基因组测序和进化分析，确定分离毒株的基因型。进一步通过Paml、RDP软件对分离株的基因组进行选择压力和基因重组分析，确定分离株的演化趋势。结果表明，分离的3株水禽细小病毒均属于新型鹅细小病毒，分别命名为YiCH株、AnQ株和XiY株，基因组长度分别为5 056、5 056、5 068 bp。3个分离株与新型鹅细小病毒M15株亲源关系最近，其中XiY株两端ITR区域191～196位、4 878～4 883位均有6个碱基插入。对分离株进行选择压力分析，分离株VP蛋白检测出3个正选择位点，分别为116Q、261A、485S。重组分析显示，分离株YiCH株和AnQ株都存在重组现象，以XiY株为主要亲本株、GPV 06-0329株为次要亲本株重组而成。
|
| 关 键 词： | 水禽细小病毒 新型鹅细小病毒 分离鉴定 选择压力 基因重组 |
|
