| 鸭MyoG基因启动子的生物信息学分析及其甲基化频率对基因表达的影响 |
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| 引用本文： | 吴乾锋,刘贺贺,张涛,罗俊,胡博,王继文.鸭MyoG基因启动子的生物信息学分析及其甲基化频率对基因表达的影响[J].湖南农业大学学报(自然科学版),2017,43(2). |
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| 作者姓名： | 吴乾锋 刘贺贺 张涛 罗俊 胡博 王继文 |
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| 作者单位： | 四川农业大学动物遗传育种研究所,四川温江,611130 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目，四川省科学技术厅基金项目 |
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| 摘 要： | 采用RT–PCR技术扩增和克隆鸭Myo G基因启动子,并对其启动子序列进行生物信息学分析,采用Sequenom Mass Array技术检测Cp G岛在鸭肌肉组织中的甲基化水平,用q RT–PCR检测Myo G基因的表达量。结果表明,扩增得到鸭Myo G基因启动子序列2 730 bp,对启动子序列预测后,发现存在2个Cp G岛,其中Cp G岛(–2 536~–1 997 bp)存在5个转录因子结合位点和多个真核生物结构元件。甲基化检测结果表明:在鸭的个体和组织水平上,启动子甲基化率均未聚类在一起;Cp G位点甲基化频率存在个体差异,22%Cp G位点的甲基化频率与Myo G的m RNA表达量呈负相关(P0.05),78%Cp G位点的甲基化频率呈正相关(P0.05),其中,腿肌甲基化位点Cp G_1、Cp G_26.27.28.29的甲基化频率与Myo G基因表达水平均呈显著相关(P0.05)。Myo G基因在鸭与在哺乳动物中的转录调控机制存在差异。试验中发现多个影响鸭Myo G基因转录的潜在甲基化位点,其中Cp G_1与Cp G_26.27.28.29能通过DNA甲基化修饰影响Myo G基因在鸭腿肌中的转录。本研究结果可为鸭Myo G基因转录调控提供参考依据。
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| 关 键 词： | 鸭 肌细胞生成素 启动子 DNA甲基化 |
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