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稻曲病菌致病力丧失突变菌株B-1015的T-DNA标记基因的克隆
引用本文:黄磊,胡建坤,俞咪娜,于俊杰,王亚会,郑梦婷,郑睿,刘永锋.稻曲病菌致病力丧失突变菌株B-1015的T-DNA标记基因的克隆[J].中国农业科学,2014,47(13):2552-2562.
作者姓名:黄磊  胡建坤  俞咪娜  于俊杰  王亚会  郑梦婷  郑睿  刘永锋
作者单位:南京农业大学生命科学学院;江苏省农业科学院植物保护研究所;
基金项目:国家自然科学基金(31171802);江苏省农业自主创新基金(CX(12)1003-10)
摘    要:【目的】研究稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)致病力丧失突变菌株B-1015,克隆和分析T-DNA插入位点的侧翼序列,为稻曲病菌的致病机制研究提供参考。【方法】分析稻曲病菌T-DNA插入突变体B-1015菌株的生长速率、产孢量、孢子萌发率以及致病力等生物学表型。用PCR检测T-DNA在B-1015基因组中插入的稳定性,用Southern杂交检测T-DNA插入的拷贝数,用hiTail-PCR扩增T-DNA侧翼序列,用RACE PCR克隆T-DNA标记基因,半定量RT-PCR分析所克隆基因的表达情况。【结果】与野生菌株P1相比,突变菌株B-1015的生长速率和产孢量都有较明显的降低,孢子萌发率无明显差异,致病力丧失。分子检测结果表明T-DNA在B-1015基因组中为稳定的单拷贝插入。hiTail-PCR得到的T-DNA两端侧翼序列在野生型菌株基因组上不相连,RACE PCR在两边的侧翼序列上分别克隆得到Uvt-1015R和Uvt-1015L。预测分析表明Uvt-1015R包含一个长度为948 bp的开放阅读框(open reading frame finder,ORF),可编码295个氨基酸,5′端非编码区(5′-untranslated regions,5′-UTR)长度为 341 bp,3′端非编码区(3′-untranslated regions,3′-UTR)长度为271 bp。Uvt-1015L包含一个长度为351 bp的ORF,可编码116个氨基酸,5′-UTR为31 bp,3′-UTR长度为174 bp。在已知功能的蛋白中检索,没有发现与Uvt-1015R和Uvt-1015L基因同源的蛋白。序列分析发现T-DNA插入在两个基因序列中间,RT-PCR结果显示,在突变菌株B-1015中,Uvt-1015R表达量下降,Uvt-1015L不表达。【结论】 稻曲病菌突变菌株B-1015致病力等重要生物学表型发生改变,可能是由于T-DNA的插入导致了B-1015基因组重排和Uvt-1015R、Uvt-1015L基因结构的破坏。

关 键 词:稻曲病菌    致病力    T-DNA    基因克隆
收稿时间:2013-12-15

Molecular Cloning of T-DNA Targeted Genes of Ustilaginoidea virens Pathogenicity-Defective Mutant Strain B-1015
HUANG Lei-,HU Jian-Kun-,YU Mi-Na-,YU Jun-Jie-,WANG Ya-Hui-,ZHENG Meng-Ting-,ZHENG Rui-,LIU Yong-Feng-.Molecular Cloning of T-DNA Targeted Genes of Ustilaginoidea virens Pathogenicity-Defective Mutant Strain B-1015[J].Scientia Agricultura Sinica,2014,47(13):2552-2562.
Authors:HUANG Lei-  HU Jian-Kun-  YU Mi-Na-  YU Jun-Jie-  WANG Ya-Hui-  ZHENG Meng-Ting-  ZHENG Rui-  LIU Yong-Feng-
Institution:1、College of Life Sciences, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095; 2、Institute of Plant Protection, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Nanjing 210014
Abstract:
Keywords:Ustilaginoidea virens  pathogenicity  T-DNA  gene clone
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