| 基于转录组测序技术筛选花(鱼骨)卵巢发育相关基因 |
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| 引用本文： | 刘慧芬,卢良盛,王静,周传江,顾钱洪,马晓,冯军厂,聂国兴,李学军.基于转录组测序技术筛选花(鱼骨)卵巢发育相关基因[J].水产学报,2019,43(8):1714-1722. |
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| 作者姓名： | 刘慧芬 卢良盛 王静 周传江 顾钱洪 马晓 冯军厂 聂国兴 李学军 |
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| 作者单位： | 河南师范大学水产学院, 河南省水产动物养殖工程技术研究中心, 河南 新乡 453007,河南师范大学水产学院, 河南省水产动物养殖工程技术研究中心, 河南 新乡 453007,河南师范大学水产学院, 河南省水产动物养殖工程技术研究中心, 河南 新乡 453007,河南师范大学水产学院, 河南省水产动物养殖工程技术研究中心, 河南 新乡 453007,河南师范大学水产学院, 河南省水产动物养殖工程技术研究中心, 河南 新乡 453007,河南师范大学水产学院, 河南省水产动物养殖工程技术研究中心, 河南 新乡 453007,河南师范大学水产学院, 河南省水产动物养殖工程技术研究中心, 河南 新乡 453007,河南师范大学水产学院, 河南省水产动物养殖工程技术研究中心, 河南 新乡 453007,河南师范大学水产学院, 河南省水产动物养殖工程技术研究中心, 河南 新乡 453007 |
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| 基金项目： | 河南省创新型科技团队支持计划（CXTD2016043）；河南省科技攻关重点项目（162102110147；182102110383）；农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室开放课题；河南师范大学博士科研启动课题（qd15186）；河南师范大学校青年基金 |
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| 摘 要： | 为筛选影响花■卵巢发育相关的基因,采用Illumina Hiseq技术对花■脑、卵巢和肝脏组织进行高通量转录组测序。结果显示,3个组织分别产生了49 484 132、47 540 538和50 622 304个clean reads,组装后共获得了99 878个unigenes,平均长度为1 430 bp。DE seq分析发现,在脑vs.卵巢组中特异性表达的基因数为2 305个,脑vs.肝脏组中特异性表达的基因数为839个,卵巢vs.肝脏组中特异性表达的基因数为1 474个,3个比较组共有的差异表达基因数为860个。GO分析发现,上述差异表达基因主要集中在初级代谢过程(primary metabolic process)、单细胞过程(single-organism process)、有机物代谢过程(organic substance metabolic process)等生物学过程中。KEGG pathway分析显示,一些与卵巢发育和减数分裂相关的信号通路得到了显著富集,如GnRH信号通路、类固醇激素合成、TGF-β信号通路、卵母细胞减数分裂等代谢通路。本研究结果丰富了花■的基因资源,可为花■的繁殖生物学研究提供基础数据。
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| 关 键 词： | 花(鱼骨) 卵巢发育 转录组 |
| 收稿时间： | 2018/8/22 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2018/11/7 0:00:00 |
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