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淡色库蚊氯菊酯抗性相关基因PR-XP1 cDNA的克隆与序列分析
引用本文:段晓雷,温雪梅,刘虎岐.淡色库蚊氯菊酯抗性相关基因PR-XP1 cDNA的克隆与序列分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2011,39(11):194-200.
作者姓名:段晓雷  温雪梅  刘虎岐
作者单位:西北农林科技大学 生命科学学院;西北农林科技大学 生命科学学院;西北农林科技大学 生命科学学院
基金项目:西北农林科技大学青年学术骨干研究基金项目(01140302)
摘    要:【目的】克隆淡色库蚊一个全新的氯菊酯抗性相关基因PR-XP1的全长序列,分析、预测其编码蛋白的结构与功能,为阐明该基因的抗性机制及研制新型卫生杀虫剂奠定基础。【方法】依据抗性与敏感品系库蚊差异表达的EST片段(GenBank号:EC093826.1),设计特异性PCR引物,采用RACE技术,克隆淡色库蚊氯菊酯抗性相关基因PR-XP1的全长cDNA序列,运用生物信息学软件对其同源性与系统进化进行分析,并对PR-XP1编码蛋白的结构与功能进行预测。【结果】获得了全长为2 004bp的淡色库蚊氯菊酯抗性相关基因PR-XP1,该基因具有完整的CDS区,编码249个氨基酸。同源性比对与系统进化分析表明,PR-XP1基因核苷酸序列与致倦库蚊(GenBank号:XM001862469.1)、埃及伊蚊(GenBank号:XM001658032.1)和冈比亚按蚊(GenBank号:BX021208.1)相关基因的同源性分别为95%,83%和70%;其编码蛋白的氨基酸序列与致倦库蚊、埃及伊蚊、西方蜜蜂、入侵红火蚁、佛罗里达弓背蚁、印度跳蚁等昆虫中"假设性蛋白"的氨基酸序列同源性均达46%以上。结构分析显示,PR-XP1基因编码蛋白可能为具有2个跨膜螺旋的膜蛋白,跨膜区形成了一个特异性的"U"形结构;该基因还具有1个微弱的信号肽位点和24个磷酸化位点。【结论】克隆得到了一个全新的淡色库蚊氯菊酯抗性相关的"保守性假设蛋白"基因PR-XP1,推测其功能与氯菊酯抗性相关。

关 键 词:淡色库蚊  氯菊酯抗性  保守性假设蛋白  生物信息学分析
收稿时间:5/4/2011 12:00:00 AM

Cloning and sequence analysis of full length cDNA of permethrin resistance associated gene PR-XP1 of Culex pipiens pallens
DUAN Xiao-lei,WEN Xue-mei,LIU Hu-qi.Cloning and sequence analysis of full length cDNA of permethrin resistance associated gene PR-XP1 of Culex pipiens pallens[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2011,39(11):194-200.
Authors:DUAN Xiao-lei  WEN Xue-mei  LIU Hu-qi
Institution:DUAN Xiao-lei,WEN Xue-mei,LIU Hu-qi (College of Life Sciences,Northwest A&F University,Yangling,Shaanxi 712100,China)
Abstract:
Keywords:Culex pipiens pallens  permethrin-resistance  conserved hypothetical protein  bioinformatic analysis
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