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光棘球海胆的主要卵黄蛋白cDNA序列分析
引用本文:周遵春,包振民,董颖,赫崇波,韩家波,王丽梅.光棘球海胆的主要卵黄蛋白cDNA序列分析[J].中国水产科学,2006,13(3):352-359.
作者姓名:周遵春  包振民  董颖  赫崇波  韩家波  王丽梅
作者单位:1. 中国海洋大学,生命科学与技术学部,山东,青岛,266003;辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室,辽宁省应用海洋生物技术开放实验室,辽宁,大连,116023
2. 中国海洋大学,生命科学与技术学部,山东,青岛,266003
3. 辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室,辽宁省应用海洋生物技术开放实验室,辽宁,大连,116023
摘    要:提取成熟光棘球海胆(Strongylocentrotus nudus)性腺中的RNA做模板,根据NCBI数据库中已知海胆(编号:AB097218、AB192414、AY090112)主要卵黄蛋白MYP cDNA保守序列设计引物,用LA PCR方式分段扩增并测序得到了光棘球海胆MYP cDNA的全序列。扩增的cDNA全长4 061 bp,包含4 047 bp的开放阅读框,共编码1 349个氨基酸。用CluxtalX1.83对光棘球海胆与其他几种已知海胆MYP cDNA及推导的氨基酸序列进行比对,用Mega3.01计算遗传距离及构建进化树,结果表明,光棘球海胆与其他7种海胆的MYP具有高度的同源性。从氨基酸水平上看,光棘球海胆与红海胆(Pseudocentrotus depressus)亲缘关系最近,遗传距离为0.069±0.01;与同科的马粪海胆(Hemicentrotus pulcher-rimus)、紫球海胆(S.purpuratus)、中间球海胆(S.intermedius)的遗传距离分别是0.095±0.012、0.098±0.011和0.101±0.012;与白棘三列海胆(Tripneustes gratilla)、拟球海胆(Paracentrotus lividus)及绿海胆(Lytechinus variega-tus)亲缘关系相对较远,遗传距离分别是0.216±0.017、0.218±0.017和0.535±0.028。获得光棘球海胆MYP cDNA序列可为进一步研究MYP基因的功能和系统的进化分析奠定基础

关 键 词:光棘球海胆  主要卵黄蛋白cDNA  序列分析
文章编号:1005-8737-(2006)03-0352-08
收稿时间:2005-08-29
修稿时间:2005-12-15

Analysis of cDNA encoding major yolk protein (MYP) in sea urchin Strongylocentrotus nudus
ZHOU Zun-chun,BAO Zhen-min,DONG Ying,HE Chong-bo,HAN Jia-bo,WANG Li-mei.Analysis of cDNA encoding major yolk protein (MYP) in sea urchin Strongylocentrotus nudus[J].Journal of Fishery Sciences of China,2006,13(3):352-359.
Authors:ZHOU Zun-chun  BAO Zhen-min  DONG Ying  HE Chong-bo  HAN Jia-bo  WANG Li-mei
Abstract:
Keywords:Strongylocentrotus nudus  major yolk protein (MYP) cDNA  sequence analysis  
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