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稻曲病菌的SCAR标记及其PCR检测
引用本文:陈福如,林廷邦,甘林,杜宜新,阮宏椿,杨秀娟.稻曲病菌的SCAR标记及其PCR检测[J].植物保护学报,2013,40(6):481-487.
作者姓名:陈福如  林廷邦  甘林  杜宜新  阮宏椿  杨秀娟
作者单位:福建省农业科学院植物保护研究所, 福州 350013;福建农林大学植物保护学院, 福州 350002;福建省农业科学院植物保护研究所, 福州 350013;福建省农业科学院植物保护研究所, 福州 350013;福建省农业科学院植物保护研究所, 福州 350013;福建省农业科学院植物保护研究所, 福州 350013
基金项目:公益性行业(农业)科研专项(200903039-5);福建省科技厅公益类科研专项(2010R1026-3);福建省科技创新平台建设项目(2009N2005)
摘    要:为建立稻曲病菌Ustilaginoidea virens快速、灵敏的PCR早期检测技术,以S380为引物,对稻曲病菌和其它参试病原菌的DNA进行RAPD-PCR扩增。稻曲病菌RAPD特异片段经回收、克隆和测序后,根据序列用Primer 5.0软件设计了特异性SCAR引物US-SF(5’-TCGCCTCAGACCTCAATC-3’)/US-SR(5’-GAGCCTCAAATGCCTTCC-3’)和巢式PCR引物US-NF(5’-AGCGTCTCCTGCAACC-AC-3’)/US-NR(5’-GAGCCTCAAATGCCTTCC-3’)。利用引物US-SF/US-SR通过常规PCR对供试稻曲病菌均可扩增出1条大小约257 bp的清晰条带,对其它植物病原菌DNA的PCR产物均无扩增条带,最低可检测到1 pg/μL 的病菌基因组DNA;而利用引物US-SF/US-SR和US-NF/US-NR通过巢式PCR可从10 fg/μL的病菌基因组DNA中扩增出1条大小约210 bp的特异性条带。试验表明,巢式PCR检测灵敏度比常规PCR提高了100倍,且巢式PCR可从接菌的水稻幼颖和自然感染的谷粒中检测出稻曲病菌。

关 键 词:水稻  稻曲病菌  RAPD特异片段  SCAR标记  PCR检测
收稿时间:2013/8/27 0:00:00

SCAR marker and PCR detection of Ustilaginoidea virens
Chen Furu,Lin Tingbang,Gan Lin,Du Yixin,Ruan Hongchun and Yang Xiujuan.SCAR marker and PCR detection of Ustilaginoidea virens[J].Acta Phytophylacica Sinica,2013,40(6):481-487.
Authors:Chen Furu  Lin Tingbang  Gan Lin  Du Yixin  Ruan Hongchun and Yang Xiujuan
Institution:Institute of Plant Protection, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350013, Fujian Province, China;College of Plant Protection, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, Fujian Province, China;Institute of Plant Protection, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350013, Fujian Province, China;Institute of Plant Protection, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350013, Fujian Province, China;Institute of Plant Protection, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350013, Fujian Province, China;Institute of Plant Protection, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350013, Fujian Province, China
Abstract:
Keywords:rice  Ustilaginoidea virens  specific RAPD fragment  SCAR marker  PCR detection
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