茶树儿茶素合成相关MYB转录因子生物信息学分析 |
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引用本文: | 张玥,胡雲飞,王树茂,柯子星,林金科.茶树儿茶素合成相关MYB转录因子生物信息学分析[J].茶叶科学,2018(2):162-173. |
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作者姓名: | 张玥 胡雲飞 王树茂 柯子星 林金科 |
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作者单位: | 福建农林大学安溪茶学院,福建 福州,350002 |
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基金项目: | 福建省教育厅中青年教师教育科研项目,福建农林大学人才引进科研启动基金,国家自然科学基金 |
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摘 要: | 从茶树(Camellia sinensis)转录组数据库中获得6个与儿茶素合成相关的MYB转录因子,对其进行蛋白理化性质与结构功能预测、核定位信号和蛋白保守结构域分析,通过同源分析构建系统发育树。结果表明,与儿茶素合成相关的6个MYB蛋白都属于亲水性的非分泌蛋白,定位在叶绿体、线粒体和细胞核上,其空间结构主要是α-螺旋和β-转角;保守结构域的分析发现除了comp159173_c0基因,其余5个都属于SANT超家族基因成员。系统进化树显示6个MYB蛋白形成4个分支,显示出各自间较远的亲缘关系。差异表达分析的结果进一步证实了6个MYB转录因子与儿茶素合成代谢的相关性。
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