| 保护品种云茶1号茶树全长转录组测序分析 |
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| 引用本文： | 朱兴正,夏丽飞,陈林波,孙云南,田易萍,宋维希,蒋会兵.保护品种云茶1号茶树全长转录组测序分析[J].茶叶科学,2018(2):193-201. |
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| 作者姓名： | 朱兴正 夏丽飞 陈林波 孙云南 田易萍 宋维希 蒋会兵 |
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| 作者单位： | 云南省农业科学院茶叶研究所/云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心,云南 勐海 666201;云南省茶学重点实验室,云南 勐海 666201 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目，云南省人才培养计划项目 |
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| 摘 要： | 为探讨云茶1号茶树品种优异性状的遗传基础,采用Pac Bio平台进行全长转录组测序,最终获得Polished consensus序列213 389个,预测到CDS有223 120个,检测到195 062个SSR位点。在NR数据库有170 264个同源序列比对到980个物种;有103 124个在KOG数据库得到注释,根据其功能各分为26类;有65 524个得到GO注释分为细胞组分、分子功能及生物学过程等三大类的55个功能组;根据KEGG数据库,105 972个得到了注释,涉及到216个代谢途径分支,包括茶叶品质、活性物质代谢以及抗逆等相关基因等;还预测到隶属于60个转录因子家族的转录因子有5 785个。这些结果为进一步开展云茶1号茶树特异性状基因的标记性引物开发、遗传研究以及品质形成和抗逆机制研究奠定了基础。
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| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
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