绵羊痘病毒ORF121基因的序列分析及其B细胞表位预测 |
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引用本文: | 陈轶霞,乔自林,刘俊林,王明明,陆会宁,郑亚东,陈智华.绵羊痘病毒ORF121基因的序列分析及其B细胞表位预测[J].黑龙江畜牧兽医,2009(3). |
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作者姓名: | 陈轶霞 乔自林 刘俊林 王明明 陆会宁 郑亚东 陈智华 |
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作者单位: | 陈轶霞,乔自林,刘俊林,王明明,陆会宁(西北民族大学生命科学与工程学院,甘肃,兰州,730030);郑亚东(中国农业科学院,兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室/甘肃省动物寄生虫病重点实验室/中国农业科学院人兽共患病重点实验室,甘肃,兰州,730046);陈智华(甘肃农业大学,甘肃,兰州,730070)
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基金项目: | 西北民族大学中青年科研基金,中国农业科学院兰州兽医研究所所长基金 |
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摘 要: | 选取GenBank上4株不同绵羊痘毒株ORF121基因序列,采用DNASTAR软件对该基因序列进行同源性分析,并以B细胞表位分析参数及蛋白质二级结构分析数据,综合预测ORF121蛋白B细胞表位.结果表明:4株不同绵羊痘毒株OBF121基因核苷酸序列的同源性为99%;在ORF121蛋白的肽链中,35~46、76~82、160~167区段亲水性强,35~45、54~83、90~124、130~139、144~158和160~167区段柔韧性好,37~45、112~116、129~137和143~167区段抗原指数高,33~45、78~83和159~167区段表面可及性高,30~57和151~170区段可形成一定的空间构象.结果说明ORF121基因在不同的绵羊痘病毒流行株之间非常保守,ORF121蛋白35~45、160~167区段可能是B细胞表位优势区,具有潜在的疫苗或/和诊断价值.
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关 键 词: | 绵羊痘病毒 序列分析 B细胞表位 |
Analysis and prediction of the B cell epitopes of ORF121 gene from Sheeppox virus |
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Abstract: | |
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Keywords: | ORF121 |
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