| 盐藻DsMAPKKK基因的克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王逸云,柴晓杰,韩冬梅,刘世才,郭卫华.盐藻DsMAPKKK基因的克隆与生物信息学分析[J].中国农学通报,2014,30(15):274-281. |
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| 作者姓名： | 王逸云 柴晓杰 韩冬梅 刘世才 郭卫华 |
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| 作者单位： | 大连海洋大学 |
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| 基金项目： | 盐藻中磷酸化转录因子对盐胁迫的分子响应;胰蛋白酶抑制剂基因在盐藻中的高效表达 |
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| 摘 要： | 为了阐明MAPKs级联反应在盐藻耐盐机制中发挥的作用，需要克隆MAPKs信号转导途径中的成员之一MAPKKK基因并研究其功能。采用RT-PCR与RACE技术从盐藻中首次克隆到一个盐藻MAPKK激酶基因，将其命名为DsMAPKKK (GenBank Accession No.KF366904)并进行了生物信息学分析。结果表明，DsMAPKKK基因的cDNA全长为1460 bp，开放阅读框为879 bp，编码292个氨基酸；该蛋白无信号肽，无跨膜域，是定位于细胞质基质的亲水性不稳定蛋白质；蛋白质序列中包含一个24—45位的蛋白激酶ATP结合区和一个137—149位的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性区；发现了多个潜在的磷酸化位点和一个重要的催化活性位点Asp141；蛋白质二级结构的主要组成元件为α -螺旋和自由卷曲；成功构建了蛋白质三级结构立体模型；系统进化分析表明该蛋白质与团藻、衣藻的相应蛋白进化关系最近。
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| 关 键 词： | 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2013/10/21 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2013/11/19 0:00:00 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of a DsMAPKKK Gene from Dunaliella salina |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Bioinformatics |
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