| 三黄鸡MAVS基因克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 曹艳杰,何怡宁,王海勇,唐宁,张丽华,韦平,韦天超,磨美兰.三黄鸡MAVS基因克隆及生物信息学分析[J].南方农业学报,2016(7):1216-1221. |
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| 作者姓名： | 曹艳杰 何怡宁 王海勇 唐宁 张丽华 韦平 韦天超 磨美兰 |
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| 作者单位： | 广西大学动物科学技术学院,南宁,530005 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31360611)，广西自然科学基金项目(2014GXNSFDA118011 |
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| 摘 要： | 【目的】掌握三黄鸡线粒体抗病毒信号蛋白(MAVS)基因的生物信息学,为MAVS基因诱导表达及禽类固有免疫相关机制研究打下基础。【方法】根据Gen Bank中已公布的原鸡MAVS基因序列设计1对特异性引物,采用RT-PCR扩增三黄鸡MAVS基因,并应用相关生物软件进行序列分析及其蛋白结构预测。【结果】三黄鸡MAVS基因编码区(CDS)全长1926 bp,编码641个氨基酸,与Gen Bank中已发表的原鸡MAVS氨基酸序列(NP_001012911.1)比对,三黄鸡MAVS氨基酸序列在第440、488、506和606位存在4个氨基酸差异,分别为440A→T、488P→L、506I→L和606E→K。三黄鸡MAVS基因与原鸡的相似性最高,达99.0%;与日本鹌鹑的相似性次之,为91.0%;与斑马鱼的相似性最低,仅37.6%。三黄鸡MAVS蛋白分子质量为67.79 ku,理论等电点(p I)为5.04,属于跨膜蛋白,无信号肽序列;其二级结构中折叠占0.5%,无规则卷曲占88.7%,螺旋占10.8%。【结论】三黄鸡MAVS基因序列表现出高度的保守性,可作为今后研究三黄鸡抗病毒机制的重要指标之一。
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| 关 键 词： | 三黄鸡 MAVS基因 克隆 生物信息学 相似性 |
Cloning and bioinformatics analysis of MA VS gene from Sanhuang chicken |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sanhuang chicken MAVS gene cloning bioinformatics similarity |
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