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| 不结球白菜抗芜菁花叶病毒蛋白BcTuRsO的生物信息学分析 | |
| 引用本文： | 马景蕃,侯喜林,肖栋,孙菲菲,单晓政,刘同坤.不结球白菜抗芜菁花叶病毒蛋白BcTuRsO的生物信息学分析[J].江苏农业学报,2010,26(2). |
| 作者姓名： | 马景蕃 侯喜林 肖栋 孙菲菲 单晓政 刘同坤 |
| 作者单位： | 1. 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏,南京,210095;龙岩学院生命科学学院,福建,龙岩,364000 2. 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏,南京,210095;农业部南方蔬菜遗传改良重点开放实验室,江苏,南京,210095 3. 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏,南京,210095 |
| 基金项目： | 江苏省自然科学基金创新学者攀登项目(BK2008035);;农业部现代农业产业技术体系建设专项基金项目(大宗蔬菜) |
| 摘 要： | 采用生物信息学方法,利用多种在线软件对不结球白菜抗芜菁花叶病毒(TuMV)蛋白BcTuRsO的系统进化、理化性质、亲水性、跨膜区、亚细胞定位、所含模体及蛋白质结构进行预测和分析。系统进化树分析结果表明,该蛋白在不同物种之间具有保守性。理化性质分析结果显示该酶含194个氨基酸,分子量为21 731.3,理论等电点pI值为6.60。TMpred跨膜分析结果显示,它含有1个显著的跨膜螺旋区,这个区域与ProtScale预测的疏水区基本重叠。用Target P server和WOLFPSORTserver程序预测该蛋白为细胞质蛋白。结构域分析结果显示该蛋白含多种磷酸化位点。二级结构以α-螺旋和随机卷曲为主。 |
| 关 键 词： | 不结球白菜 抗病毒蛋白BcTuRsO 生物信息学 |
Bioinformatic Analysis of BcTuRsO Related to TuMV Resistance of Brassica campestris ssp. chinensis |
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| MA Jing-fan,HOU Xi-lin,XIAO Dong,SUN Fei-fei,SHAN Xiao-zheng,LIU Tong-kun.Bioinformatic Analysis of BcTuRsO Related to TuMV Resistance of Brassica campestris ssp. chinensis[J].Jiangsu Journal of Agricultural Sciences,2010,26(2). | |
| Authors: | MA Jing-fan HOU Xi-lin XIAO Dong SUN Fei-fei SHAN Xiao-zheng LIU Tong-kun |
| Institution: | 1.State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement/a>;Nanjing Agricultural University/a>;Nanjing 210095/a>;China/a>;2.College of Life Sciences/a>;Longyan University/a>;Longyan 364000/a>;3.Key Laboratory of Southern Vegetable Crop Genetic Improvement/a>;Ministry of Agriculture/a>;China |
| Abstract: | The BcTuRsO related to TuMV(Turnip mosaic virus,TuMV) resistance of Brassica campestris ssp.chinensis was analyzed by using a series of online software in the following aspects: phylogenetic analysis,physical and chemical characters,hydrophobicity,transmembrane topologieal structure,subcellular localization,motif,secondary and tertiary structure of the protein,and so on.Phylogenetic analysis reveals the evolutionary conservation of these proteins among diverse species.The protein contains 194 amino acid res... |
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