| Pseudomonas stutzeri|A1501基因组结构及功能注释 |
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| 引用本文： | 燕永亮,杨剑,窦岳坦,平淑珍,王忆平,金奇,林敏.Pseudomonas stutzeri|A1501基因组结构及功能注释[J].中国农业科技导报,2008,10(5):45-52. |
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| 作者姓名： | 燕永亮 杨剑 窦岳坦 平淑珍 王忆平 金奇 林敏 |
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| 作者单位： | [1]中国农业科学院生物技术研究所,北京100081 [2]病毒基因工程国家重点实验室,北京100176 [3]北京大学生命科学学院,北京100871 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973计划)
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国家高技术研究发展计划(863计划)
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国家自然科学基金
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| 摘 要： | 采用全基因组“shotgun”方法完成了固氮斯氏假单胞菌A1501的全基因组序列测定,并进行了基因组结构与功能注释分析。A1501基因组全长4 567 418 bp,含有4 146个ORFs。该基因组中已鉴定了42个编码转座酶的重复序列,这些序列的存在预示着转座现象在A1501菌中非常活跃,预示该菌与其他生物之间基因交流可能比较频繁。比较基因组表明,为了适应特定的生存环境,假单胞菌在基因组结构和遗传信息容量上产生了明显的分化。此外,基因组分析鉴定了A1501环境适应的遗传基础,包括物质转运、信号传导和趋化系统等,这些系统是细菌能够在根际土壤环境中保持竞争力以及能够与水稻形成高效联合固氮体系的关键。A1501基因组的完成为进一步开展功能基因组学和蛋白质组学研究奠定了基础。
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| 关 键 词： | 基因组测序 斯氏假单胞菌A1501 联合固氮 比较基因组学 |
| 收稿时间： | 2008-09-02 |
| 修稿时间： | 2008-09-18 |
Genome Structure and Functional Annotation of Nitrogen- |fixing Pseudomonas stutzeri A1501 |
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| YAN Yong-liang,YANG Jian,DOU Yue-tan,PING Shu-zhen,WANG Yi-ping,JIN Qi,LIN Min.Genome Structure and Functional Annotation of Nitrogen- |fixing Pseudomonas stutzeri A1501[J].Journal of Agricultural Science and Technology,2008,10(5):45-52. |
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| Authors: | YAN Yong-liang YANG Jian DOU Yue-tan PING Shu-zhen WANG Yi-ping JIN Qi LIN Min |
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| Institution: | 1. Biotechnology Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081 ; |2. State Key Laboratory for Molecular Virology and Genetic Engineering, Beijing 100176 ; |3. College of Life Sciences, Peking University, Beijing 100871, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | genome sequencing Pseudomonas stutzeri A1501 associative nitrogen fixation comparative genomics |
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