野芝麻ISSR-PCR扩增条件优化 |
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引用本文: | 祁彩虹,金则新,李钧敏,彭礼琼,王强.野芝麻ISSR-PCR扩增条件优化[J].江苏农业科学,2011,39(2). |
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作者姓名: | 祁彩虹 金则新 李钧敏 彭礼琼 王强 |
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作者单位: | 1. 西南大学三峡库区生态环境教育部重点实验室,重庆,400715;台州学院生态研究所,浙江,临海,317000 2. 台州学院生态研究所,浙江,临海,317000 3. 台州学院生态研究所,浙江,临海,317000;北京林业大学自然保护区学院,北京100083 4. 台州学院生态研究所,浙江,临海,317000;上海师范大学生命与环境科学学院,上海,200000 |
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摘 要: | 以野芝麻(Lamium barbatum)DNA为模板,利用单因子试验分别对影响野芝麻ISSR-PCR反应的Mg(2+)浓度、BSA(小牛血清蛋白)、DNA、Taq DNA聚合酶、4 ×dNTP和引物的浓度进行了优化,并通过梯度PCR确定试验的退火温度,最终确定野芝麻最佳的反应体系及PCR扩增程序为:10μL体系,其中包括1×Buffer、Mg(2+),2.5 mmol/L、BSA10 mg/mL、模板DNA15 ng、Taq DNA聚合酶1.5U、4×dNTP0.4mmol/L、引物15pmol;扩增程序:94℃变性5 min;94℃变性30 s,55.2℃退火45 s,72℃延伸1.5 min,共35个循环;72℃再延伸5 min反应终止.利用优化后的反应条件筛选出10个ISSR引物,并对野芝麻居群进行了遗传多样性分析,多态位点百分率为82.08%,Nei指数为0.1717,Shannon信息指数为0.2381,说明野芝麻遗传多样性水平较高.该体系建立了标记位点清晰、反应系统稳定、检测多态性能力强、重复性好的扩增条件.
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关 键 词: | 野芝麻 ISSR分子标记 优化 引物筛选 |
Optimization of ISSR-PCR conditions of Lamium barbatum |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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