| 基于Web服务的禽流感病毒基因分析软件FluSoft的创建与应用 |
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| 引用本文： | 刘朔,蒋文明,彭程,尹馨,刘华雷.基于Web服务的禽流感病毒基因分析软件FluSoft的创建与应用[J].中国动物检疫,2023,40(2):146-152. |
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| 作者姓名： | 刘朔 蒋文明 彭程 尹馨 刘华雷 |
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| 作者单位： | 中国动物卫生与流行病学中心,农业农村部动物生物安全风险预警及防控重点实验室(南方) |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目（2022YFF0802404） |
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| 摘 要： | 解读病毒基因组信息是探明病毒关键分子特性的重要步骤。然而，解码基因信息，需要在较强的生物信息学背景下，查阅大量文献、选择参考序列、开展序列比对、进行遗传进化分析、验证并集成数据信息等，其过程工作量大、耗时、技术含量高。为解决上述问题，采用Perl语言集成一系列软件和数据集，创建了禽流感病毒基因分析软件（FluSoft），实现了禽流感病毒基因组快速批量注释和分析。本软件通过Web网页对话框输入FASTA格式的禽流感病毒基因序列，可进行关键生物特性和遗传进化分析，实现了以下功能：（1）注释查询序列的基因片段/亚型（针对H5或H7亚型，增加展示其HA基因裂解位点氨基酸序列及碱性氨基酸个数）及基因突变的生物学意义，如耐药性、宿主受体特异性、毒力、糖基化位点及在家禽或哺乳动物中的传播能力等；（2）注释查询序列在命名系统中最密切相关的演化分支。综上所述，FluSoft软件（http://flusoft.hqhuitong.com）为禽流感流行病学调查监测、流行特征分析及风险预警提供了有力的技术支撑。
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| 关 键 词： | 禽流感病毒 基因分析 生物特性 遗传进化 FluSoft软件 |
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