5-氮杂胞苷对苦瓜果实成熟及转录表达谱的影响 |
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引用本文: | 郭金菊,吴廷全,王茹芳,等.5-氮杂胞苷对苦瓜果实成熟及转录表达谱的影响[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2023,51(2):93-101. |
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作者姓名: | 郭金菊 吴廷全 王茹芳 等 |
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作者单位: | 广东省农业科学院 设施农业研究所 |
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基金项目: | 广东省现代农业产业技术体系创新团队项目(2021KJ110);广东省农业科学院院长基金项目(202028);广东省农业科学院创新基金项目(202149);广东省农业科学院学科团队建设项目(202130TD);广东省农业科学院科技创新战略专项资金(高水平农科院建设)-人才项目(R2018QD-037) |
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摘 要: | 【目的】研究5-氮杂胞苷(5-azaC)对苦瓜果实成熟和基因表达模式的影响,为解析苦瓜果实成熟的分子调控机制提供理论依据。【方法】以苦瓜(Momordica charantia L.)高世代自交系E12201-e1为材料,利用50 mmol/L 5-azaC处理绿熟期(授粉后18 d)苦瓜果实,以ddH2O处理为对照,观察处理组(TR)和对照组(CK)果实的表型变化,并利用RNA-seq技术比较TR和CK苦瓜果肉组织中的转录水平差异。【结果】50 mmol/L 5-azaC处理能明显延迟苦瓜果实成熟。RNA-seq获得的数据质量较高,可满足后续分析需求。通过筛选共获得1 773个差异表达基因(DEGs),其中1 007个上调基因,766个下调基因。GO和KEGG分析结果表明,DEGs主要富集在细胞组分和分子功能模块,217个DEGs共富集到93条代谢通路中,其中30个DEGs显著富集到光合作用和苯丙烷类生物合成通路。8个DEGs参与细胞壁代谢过程,其中6个基因在5-azaC处理中下调表达。共获得681个差异表达转录因子(TFs),分属于220个TF家族。12个DEGs的qRT-PCR结果与RNA-seq结果变化趋势一致。【结论】5-azaC处理抑制苦瓜果实成熟,并影响果实成熟相关基因的表达模式。
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关 键 词: | 苦瓜 5-氮杂胞苷 转录组测序 果实成熟 |
收稿时间: | 2022/1/12 0:00:00 |
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