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| 谷子XTH基因家族与抗旱相关基因的分析 | |
| 作者单位： | ;1.山西农业大学农学院;2.杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室;3.农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室 |
| 摘 要： | 目的]木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(XTH)属于糖苷水解酶GH16家族,其家族成员可能在植物响应逆境胁迫的过程中发挥重要作用,为深入挖掘谷子抗旱基因,进而选育谷子抗逆新品种,方法]本研究利用生物信息学手段,对谷子XTH基因家族进行了分析。结果]从谷子基因组数据库中鉴定出16个XTH基因。结构分析表明:SiXTH家族成员在基因结构及编码区序列上较为保守,含1~3个内含子;谷子XTH蛋白含有XTH家族典型的保守基序DEIDFEFLG;预测SiXTH基因家族成员在启动子区域含有响应逆境胁迫的顺式作用元件。在干旱胁迫下,通过比较两个谷子品种勾勾母鸡咀及晋汾16在干旱胁迫下基因的相对表达水平,我们发现了3个上调表达和1个下调表达的SiXTH基因。结论]因此推测,同一类基因其基因结构及蛋白结构域相似,且XTH基因家族在谷子应答干旱胁迫的过程中起一定的作用,同时本研究也为深入探究XTH基因家族成员的功能奠定了一定的基础。 |
| 关 键 词： | 谷子 XTH 耐旱基因 功能预测 |
Analysis of XTH genes that related to drought stress in foxtail millet |
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