| 葡萄牙牡蛎外套膜转录组测序及壳色基因挖掘 |
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| 引用本文： | 严璐琪,郭香,巫旗生,祁剑飞,宁岳,王晓清,曾志南.葡萄牙牡蛎外套膜转录组测序及壳色基因挖掘[J].湖南农业大学学报(自然科学版),2016,42(4):409-414. |
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| 作者姓名： | 严璐琪 郭香 巫旗生 祁剑飞 宁岳 王晓清 曾志南 |
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| 作者单位： | 1. 湖南农业大学动物科学技术学院，湖南 长沙 410128; 水产高效健康生产湖南省协同创新中心，湖南 常德415000;2. 福建省水产研究所,福建 厦门,361000 |
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| 基金项目： | 现代农业产业技术体系建设专项(CARS-48)；福建省种业工程项目(201451477-9)；福建省属公益类科研院所基本科研专项(2015R1003-8) |
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| 摘 要： | 采用Illumina高通量测序平台对黑壳与金壳葡萄牙牡蛎(Crassostrea angulata)外套膜组织开展转录组测序研究,其中黑壳组总计产出5 857 718 092 nt数据,筛选后的干净阅读子58 004 560个;金壳组产出6 727 447 326 nt数据,干净阅读子66 614 854个。将发掘的新基因与COG、GO、KEGG、Swiss-Prot、NR数据库进行序列比对,最终得到各数据库注释的新基因数量分别为147、397、203、567、1 347个。通过对差异表达基因的序列进行生物学功能注释和聚类分析以及利用已知贝壳基质蛋白序列进行搜索,鉴定出14条可能与壳色表达有关的贝壳基质蛋白基因,其中5条下调基因可能与金壳基因表达相关。
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| 关 键 词： | 葡萄牙牡蛎 壳色 转录组 |
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