| 仿刺参超氧化物歧化酶基因cDNA全序列的克隆及其特征分析 |
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| 作者姓名： | 田燚 马增艳 常亚青 |
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| 作者单位： | 大连海洋大学农业部海洋水产增养殖学重点开放实验室,116023 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31072230); 国家“863”计划项目(2010AA10A401)共同资助 |
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| 摘 要： | 以仿刺参Apostichopus japonicus为材料,利用cDNA末端快速扩增(RACE)方法首次得到仿刺参MnSOD的全长cDNA。该全长cDNA大小为955bp,其中5′端非编码区67bp,3′端非编码区216bp,开放阅读框(ORF)672bp,在3′端有多聚腺苷酸信号序列ATTTA,并有polyA加尾,符合有效翻译的基因全长cDNA的特征。MnSOD全长cDNA可编码223个氨基酸的前体蛋白,预测蛋白分子质量为24.64kD,理论等电点是6.66,为亲水性蛋白。该蛋白序列没有信号肽和跨膜结构,仅有一段线粒体导肽。其二级结构主要以α-螺旋为主,无规则卷曲和延伸链构成了蛋白中量最大的结构元件,不含β-折叠。仿刺参SOD的氨基酸序列与目前已报道的其他物种如人、牛、斑马鱼、原鸡、非洲爪蟾、中国对虾、皱纹盘鲍、海湾扇贝、果蝇等的MnSOD氨基酸序列进行序列比对的结果表明,相似性均在61%～69%之间,说明该基因在各物种间具有一定的保守性。该段氨基酸序列无N-糖基化位点,含有3个蛋白激酶C磷酸化位点,1个酪氨酸蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,5个肉豆蔻酰基化位点,还发现了1个SOD家族的特征肽段DVWEHAYY。对磷...
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| 关 键 词： | 仿刺参 MnSOD 基因克隆 序列分析 |
| 收稿时间： | 2010/12/25 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2011/6/30 0:00:00 |
Cloning and sequence analysis of superoxide dismutase gene in sea cucumber Apostichopus japonicus (Selenka) |
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| Authors: | TIAN Yi MA Zeng-yan CHANG Ya-qing |
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| Institution: | TIAN Yi MA Zeng-yan CHANG Ya-qing (Key Laboratory of Mariculture,Ministry of Agriculture,Dalian Ocean University,116023) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sea cucumber MnSOD Gene cloning Sequence analysis |
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