组织培养条件下苹果Ty1-copia类逆转座子的转录活性 |
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引用本文: | 孙俊,房经贵,陶建敏,蔡斌华,章镇.组织培养条件下苹果Ty1-copia类逆转座子的转录活性[J].果树学报,2005,22(5):441-445. |
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作者姓名: | 孙俊 房经贵 陶建敏 蔡斌华 章镇 |
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作者单位: | 1. 南京农业大学园艺学院,南京,210095;安徽农业大学园艺系,合肥,230036 2. 南京农业大学园艺学院,南京,210095 |
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摘 要: | 研究了苹果基因组中Tyl—copia类逆转座子的转录活性、多样性及其甲基化水平。在培养基MS+2,4-D2mg/L+BA0.2mg/L+NAA0.5mg/L上诱导了1个月的愈伤组织中用RT—PCR方法检测到了270bp的目的条带,而对照、继代组培苗和不含2,4-D的愈伤中均没有目的条带的扩增,说明一定浓度的2,4-D可以诱导苹果中Tyl—copia类逆转座子的表达活性。将目的条带回收、克隆和测序后进行分析:所克隆的21条序列虽都为Tyl-copia类逆转座子逆转录酶保守序列,但存在很大的异质性,21个克隆的核甘酸序列变化范围为196—290bp;翻译成氨基酸后存在缺失、插入、移框和终止密码子突变,7个克隆在氨基酸保守序列‘SLYGLKQ’处有1—2氨基酸位点的突变,说明这些序列对应的逆转录酶多数可能已失去了其原有功能。将21条序列进行聚类分析,除ART20外,其它克隆可聚为3类,并分别与GenBank上某些物种的相应序列同源性很高,表明在不同物种间可能存在逆转座子的横向传递作用。甲基化试验表明苹果基因组内Tyl-copia类逆转座子甲基化水平高。这些都表明Tyl-copia类逆转座子对苹果基因型的多样性及基因组的进化具有重要意义。
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关 键 词: | 苹果 Tyl-copia类逆转座子 转录活性 组织培养 |
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