| 绵羊ATF3基因的生物信息学分析及其在营养剥夺应激下的表达变化 |
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| 引用本文： | 李俊玲,郭丽荣,郭田燕,秦健,杜荣.绵羊ATF3基因的生物信息学分析及其在营养剥夺应激下的表达变化[J].中国畜牧杂志,2021(4):117-122. |
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| 作者姓名： | 李俊玲 郭丽荣 郭田燕 秦健 杜荣 |
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| 作者单位： | 山西农业大学动物医学学院;山西农业大学实验教学中心;山西农业大学生命科学学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31872438);山西省重点研发计划项目(201803D221022-4);山西省留学回国人员科技活动择优资助项目;山西省平台基地和人才专项优秀人才科技创新项目(201605D211028);山西农业大学中青年拔尖创新人才支持计划(BJRC201204);山西农业大学横向科技项目(2015H X12)。 |
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| 摘 要： | 本研究旨在探究绵羊ATF3基因的蛋白特征、转录调控元件及其在营养剥夺应激下的表达变化。运用生物信息学相关软件对绵羊ATF3蛋白特征和ATF3基因启动子区元件进行分析预测,并在绵羊禁食3 d后检测骨骼肌中ATF3mRNA的表达量。结果显示,绵羊ATF3氨基酸数为187,分子式为C920H1521N273O282S12,等电点为8.89,不稳定系数是71.73,总平均疏水性值为-0.630;ATF3蛋白定位于细胞核,二级结构主要由α螺旋和无规则卷曲组成,三级结构与二级结构保持一致且可信度高;进化树显示绵羊ATF3与牛、山羊、猪的同源性较高;qRT-PCR结果显示,与正常组相比,禁食组绵羊骨骼肌中ATF3mRNA表达量极显著降低;绵羊ATF3基因启动子区存在CREB、NFKB、AP1和GRE等与应激有关的转录因子结合元件,暗示了ATF3表达量下调的原因可能与这些元件和相应转录因子的结合有关。
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| 关 键 词： | 绵羊 ATF3基因 生物信息学分析 营养应激 调控元件 |
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