| 小麦衰老相关基因TaSAG39的生物信息学及表达模式分析 |
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| 引用本文： | 孙丽丽,晋秀娟,赵锴,Md Ashraful Islam,卢娟,王曙光,孙黛珍.小麦衰老相关基因TaSAG39的生物信息学及表达模式分析[J].华北农学报,2022,37(2):18-27. |
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| 作者姓名： | 孙丽丽 晋秀娟 赵锴 Md Ashraful Islam 卢娟 王曙光 孙黛珍 |
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| 作者单位： | 山西农业大学 农学院,山西 太谷 030801;省部共建有机旱作农业国家重点实验室,山西 太原 030031 |
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| 基金项目： | 山西农业大学省部共建有机旱作农业国家重点实验室自主研发项目 |
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| 摘 要： | 半胱氨酸蛋白酶是蛋白质降解过程中的一类水解酶，参与植物的衰老与成熟，在植物生长发育过程中发挥重要作用。基于前期得到的小麦衰老阶段转录组数据中筛选到一个衰老特异的半胱氨酸蛋白酶(SAG39),为了研究TaSAG39基因在小麦衰老过程中发挥的作用，采用生物信息学分析方法和实时荧光定量(qRT-PCR)技术对TaSAG39的基因结构和表达模式进行分析。结果表明，其氨基酸序列与小麦祖先种节节麦、野生二粒小麦以及硬粒小麦亲缘关系最近，含有木瓜蛋白酶亚家族特有的活性位点Cys-His-Asn以及EFNIN结构。TaSAG39-5A、TaSAG39-5B、TaSAG39-5D基因组全长分别为1 455,1 435,1 439 bp,编码序列长分别为1 041,1 050,1 038 bp,均含2个外显子和1个内含子；其编码的蛋白分别由346,349,345个氨基酸组成，分子质量约37 ku,等电点5.53～5.67,为稳定的带负电的亲水性蛋白；主要构成元件为无规则卷曲和α-螺旋，在蛋白质N段含有信号肽，具有保守的Inhibitor＿I29和Peptidase＿C1结构域，含有35～37个磷酸化位点，...
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| 关 键 词： | 小麦 TaSAG39 半胱氨酸蛋白酶 生物信息学分析 表达模式 |
Bioinformatics and Expression Pattern Analysis of Senescence-associated Gene TaSAG39 in Wheat |
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| SUN Lili,JIN Xiujuan,ZHAO Kai,Md Ashraful Islam,LU Juan,WANG Shuguang,SUN Daizhen.Bioinformatics and Expression Pattern Analysis of Senescence-associated Gene TaSAG39 in Wheat[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2022,37(2):18-27. |
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| Authors: | SUN Lili JIN Xiujuan ZHAO Kai Md Ashraful Islam LU Juan WANG Shuguang SUN Daizhen |
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