螭霖鱼肠道微生物多样性分析 |
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引用本文: | 李慧,李宇飞,孟子育,郁家宝,赵永正,夏倩倩,孟超,田园.螭霖鱼肠道微生物多样性分析[J].水产养殖,2020,41(8). |
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作者姓名: | 李慧 李宇飞 孟子育 郁家宝 赵永正 夏倩倩 孟超 田园 |
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作者单位: | 山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院,山东泰安271016;山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院,山东泰安271016;山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院,山东泰安271016;山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院,山东泰安271016;山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院,山东泰安271016;山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院,山东泰安271016;山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院,山东泰安271016;山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院,山东泰安271016 |
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基金项目: | 国家自然科学基金;山东省自然科学基金;泰安市科技局项目 |
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摘 要: | 分析螭霖鱼肠道微生物的群落结构组成及多样性差异,研究其与其肠道内共生微生物的协同进化关系。提取螭霖鱼的肠道内容物及粪便微生物DNA样本,利用高通量测序技术进行16S V4区域扩增子测序以及生物信息学分析,共得到250 958条序列。基于97%的样本相似度,样本优化聚类为1200个OTU(Operational taxonomical unit),共涉及13门24纲42目56科75属。在属水平上黄杆菌属(Flavobacterium)(44.72%)、蓝黑紫色杆菌属(Janthinobacterium)(14.08%)和气单胞菌属(Aeromonas)(9.29%)为主要优势菌群,其余菌种所占比例不大。螭霖鱼肠道内微生物群落组成较为相似,无统计学意义差异。
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关 键 词: | 螭霖鱼 测序 16S rRNA |
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