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螭霖鱼肠道微生物多样性分析
引用本文:李慧,李宇飞,孟子育,郁家宝,赵永正,夏倩倩,孟超,田园.螭霖鱼肠道微生物多样性分析[J].水产养殖,2020,41(8).
作者姓名:李慧  李宇飞  孟子育  郁家宝  赵永正  夏倩倩  孟超  田园
作者单位:山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院,山东泰安271016;山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院,山东泰安271016;山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院,山东泰安271016;山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院,山东泰安271016;山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院,山东泰安271016;山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院,山东泰安271016;山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院,山东泰安271016;山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院,山东泰安271016
基金项目:国家自然科学基金;山东省自然科学基金;泰安市科技局项目
摘    要:分析螭霖鱼肠道微生物的群落结构组成及多样性差异,研究其与其肠道内共生微生物的协同进化关系。提取螭霖鱼的肠道内容物及粪便微生物DNA样本,利用高通量测序技术进行16S V4区域扩增子测序以及生物信息学分析,共得到250 958条序列。基于97%的样本相似度,样本优化聚类为1200个OTU(Operational taxonomical unit),共涉及13门24纲42目56科75属。在属水平上黄杆菌属(Flavobacterium)(44.72%)、蓝黑紫色杆菌属(Janthinobacterium)(14.08%)和气单胞菌属(Aeromonas)(9.29%)为主要优势菌群,其余菌种所占比例不大。螭霖鱼肠道内微生物群落组成较为相似,无统计学意义差异。

关 键 词:螭霖鱼  测序  16S  rRNA
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