| 甘蔗ScHAK10基因克隆及表达分析 |
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| 引用本文： | 罗海斌,蒋胜理,黄诚梅,曹辉庆,邓智年,吴凯朝,徐林,陆珍,魏源文.甘蔗ScHAK10基因克隆及表达分析[J].作物杂志,2018,34(4):53-49. |
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| 作者姓名： | 罗海斌 蒋胜理 黄诚梅 曹辉庆 邓智年 吴凯朝 徐林 陆珍 魏源文 |
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| 作者单位： | 1 广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室,530007,广西南宁2 广西农业科学院甘蔗研究所/农业农村部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室/广西甘蔗遗传改良重点实验室,530007,广西南宁 |
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| 基金项目： | 广西自然科学基金(2014GXNSFAA118081;2013GXNSFAA019077);广西八桂学者专项项目([2013]3号);广西农业科学院基本科研业务专项项目(2015YT96;桂农科2017YM35) |
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| 摘 要： | 为探究甘蔗HAK基因家族中ScHAK10基因的功能及干旱环境下的响应机制,利用同源克隆技术（homologous cloning）从新台糖22号中克隆得到ScHAK10基因的完整编码序列,并对其进行生物信息学分析,同时采用q-PCR技术分析基因在不同组织以及在不同干旱阶段的表达情况。结果表明,ScHAK10基因编码区全长为2 433bp,编码810个氨基酸,相对分子量89.83kD,等电点（pI）为8.46,预测其为疏水碱性蛋白;核苷酸同源性分析表明ScHAK10基因与玉米（Zea mays L.）、高粱Sorghum bicolor （L.） Moench]等其他作物中HAK基因具有高度的同源性;该蛋白具有跨膜结构域,定位在细胞质膜上。蛋白质二级结构分析发现其主要由α螺旋（38.15%）、扩展长链（19.26%）和无规则卷曲（37.16%）组成;蛋白功能预测显示其与阳离子运输通道相关,有较大的概率显示其介入转录、信号传导、免疫应答等生物活动。qPCR表达分析显示,ScHAK10基因在不同部位都有表达,叶片中的表达量最高,其次为茎,根系中的表达量最低。干旱胁迫下ScHAK10基因受到诱导表达,表达水平根据胁迫程度的加深而呈现出先上调后下降的表达趋势,复水后,基因表达量降低。本研究为进一步阐明甘蔗ScHAK10基因的功能及甘蔗耐旱调控相关分子机制奠定了基础。
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| 关 键 词： | 甘蔗 钾转运蛋白基因（HAK） 基因克隆 生物信息学分析 基因表达 |
| 收稿时间： | 2018-01-25 |
Cloning and Expression of ScHAK10 Gene in Sugarcane |
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| Haibin Luo,Shengli Jiang,Chengmei Huang,Huiqing Cao,Zhinian Deng,Kaichao Wu,Lin Xu,Zhen Lu,Yuanwen Wei.Cloning and Expression of ScHAK10 Gene in Sugarcane[J].Crops,2018,34(4):53-49. |
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| Authors: | Haibin Luo Shengli Jiang Chengmei Huang Huiqing Cao Zhinian Deng Kaichao Wu Lin Xu Zhen Lu Yuanwen Wei |
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| Institution: | 1 Guangxi Crop Genetic Improvement and Biotechnology Laboratory, Nanning 530007, Guangxi, China2 Sugarcane Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of Sugarcane Biotechnology and Genetic Improvement of Guangxi, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Nanning 530007, Guangxi, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sugarcane Potassium transporter gene (HAK) Gene cloning Bioinformatics analysis Gene expression |
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