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木豆贮藏蛋白基因的克隆及其序列分析
引用本文:唐军,王文强,白昌军,金志强.木豆贮藏蛋白基因的克隆及其序列分析[J].热带作物学报,2012,33(4):668-673.
作者姓名:唐军  王文强  白昌军  金志强
作者单位:1. 海南大学农学院 海南海口571101;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所 农业部热带作物种质资源利用重点开放实验室 海南儋州 571737
2. 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所 农业部热带作物种质资源利用重点开放实验室 海南儋州 571737
3. 中国热带农业科学院海口实验站,海南海口,570102
基金项目:现代农业产业体系建设专项资金,中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所)资助,国家十二五科技支撑计划项目资助
摘    要:根据几种豆科植物贮藏蛋白基因序列同源性设计简并引物,通过反转录扩增,经琼脂糖凝胶电泳检测和测序,并利用NCBI数据库及Blast工具进行分析,从木豆中克隆得到1个贮藏蛋白基因的cDNA片断,长度为833 bp.采用RACE、RT-PCR技术扩增得到该基因的全长cDNA,含1 595 bp,推测编码区为1551 bp(16-1566bp),编码516个氨基酸,分子量为57.718 ku,等电点为4.68.该基因推导的氨基酸与大豆(1303273A)、野生大豆(CAA55977.1)、羽扇豆(AEB33710.1)、花生(AAU21493.1)、菜豆(ADR30064.1)、野豌豆(CAA83674.1)为、截形苜蓿(XP_003590690.1)的贮藏蛋白同源性分别达到83%、79%、77%、73%、67%、65%、65%.

关 键 词:木豆  贮藏蛋白  克隆  同源性

Cloning and Analysis of the Gene Encoding Glycilin from Pigeonpea[Cajanus cajan(L.) Millsp.]
TANG Jun , WANG Wenqiang , BAI Changjun , JIN Zhiqiang.Cloning and Analysis of the Gene Encoding Glycilin from Pigeonpea[Cajanus cajan(L.) Millsp.][J].Chinese Journal of Tropical Crops,2012,33(4):668-673.
Authors:TANG Jun  WANG Wenqiang  BAI Changjun  JIN Zhiqiang
Institution:1 College of Agronomy,Hainan University,Haikou,570228 2 Tropical Crops Genetic Resources Institute,CATAS/Key Laboratory of Crop Gene Resources and Germplasm Enhancement in Southern China,Ministry of Agriculture,China,Danzhou,Hainan 571737 3 Haikou Experimental Station,CATAS,Haikou,Hainan 570102,China
Abstract:A special cDNA fragments with 833 base pairs(bp) long from the pigeonpea material was clone by means of designing degenerate primers homology to the sequences of other leguminous plants,RT-PCR amplification and agarose gel electrophoresis,blast tools.The full-length 1 595 bp cDNA encoding pigeonpea glycinlin(PPGLY)was cloned by RT-PCR,3’ and 5’RACE technology.It contained a 1 551 bp(16 to 1 566 bp)ORF,encoding 516 amino acids with PPGLY molecular weight 57.718 ku of an isoelectric point(pI)4.68.The deduced amino acid sequence of PPGLY showed high homologies 83%,79%,77%,73%,67%,65% and 65% with Glycine max(1303273A),Glycine max(CAA55977.1),Lupinus angustifolius(AEB33710.1),Arachis hypogaea(AAU21493.1),Phaseolus vulgaris(ADR30064.1),Vicia fatal(CAA83674.1),Medicago truncatula(XP003590690.1),respectively.
Keywords:Pigeonpea  Glycilin  Cloning  Homology
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