| 凡纳滨对虾育种基础群体收获体重的未知亲本组效应分析 |
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| 引用本文： | 陈美佳,孔杰,谭建,罗坤,孟宪红,卢霞,隋娟,代平,陈宝龙,曹宝祥,陈国良,栾生.凡纳滨对虾育种基础群体收获体重的未知亲本组效应分析[J].中国水产科学,2021,28(7):863-870. |
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| 作者姓名： | 陈美佳 孔杰 谭建 罗坤 孟宪红 卢霞 隋娟 代平 陈宝龙 曹宝祥 陈国良 栾生 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学水产与生命学院, 上海 201306 ；中国水产科学研究院黄海水产研究所, 农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室, 青岛海洋科学与技术试点国家实验室, 海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室, 山东 青岛 266071;中国科学院烟台海岸带研究所, 山东 烟台 264003;海茂种业科技集团有限公司, 广东 湛江 524001 |
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| 基金项目： | 山东省农业良种工程项目(2017LZN011)； 所级基本科研业务费项目(20603022020003)； 科技部重点研发计划项目(2018YFD0901301)； 中国水产科学研究院基本科研业务费专项(2020TD26)； 山东省农业重大应用技术创新项目(SD2019YY001). |
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| 摘 要： | 由于凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)属国外引进种, 国内引进群体间(内)的亲缘关系及其遗传背景不清楚。为分析凡纳滨对虾基础群体中这些未知亲本组(unknown parent group, UPG)的效应, 本研究收集生长速度和养殖存活率差异较大的 3 个凡纳滨对虾群体作为奠基者群体, 通过双列杂交方法构建育种基础群体, 利用 pBLUP (best linear unbiased prediction based on pedigree)、包含遗传组的 pBLUP-GG (pBLUP with genetic groups), ssGBLUP (single step genomic BLUP)和包含 Metafounders 的 ssGBLUP-MF (ssGBLUP with Metafounders)等 4 种模型, 对比分析 UPG 对基础群体收获体重遗传参数和育种值估计值的影响。结果显示, 利用 pBLUP 模型获得的加性遗传方差 (22.58±4.39)和遗传力(0.91±0.10)最高, 与之相比, pBLUP-GG、ssGBLUP、ssGBLUP-MF 模型获得的加性遗传方差降低了 16.25%~61.20%, 遗传力降低了 15.38%~46.15%。5 折交叉验证结果表明: pBLUP 模型的预测准确性最低 (0.64~0.68), 与之相比, 其他 3 种模型的预测准确性高 7.25%~10.53%; pBLUP 模型的预测偏差较大(1.06~ 1.19), 其他 3 种模型的预测偏差降低了 2.83%~7.56%。综上所述, 与 pBLUP 模型相比, 在模型中考虑 UPG 效应可避免基础群体收获体重加性遗传方差组分被高估, 且进一步提高了 EBV (GEBV)的预测准确性。本研究旨在为准确评估凡纳滨对虾育种基础群体的遗传参数提供可借鉴的遗传评估模型和方法。
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| 关 键 词： | 凡纳滨对虾 生长 未知亲本组效应 遗传参数 单步基因组评估 |
Unknown parental group effects on harvest body weight in the base population of Litopenaeus vannamei |
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| Chen Meiji,Kong Jie,Tan Jian,Luo Kun,Meng Xianhong,Lu Xi,Sui Juan,Dai Ping,Chen Baolong,Cao Baoxiang,Chen Guoliang,Luan Sheng.Unknown parental group effects on harvest body weight in the base population of Litopenaeus vannamei[J].Journal of Fishery Sciences of China,2021,28(7):863-870. |
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| Authors: | Chen Meiji Kong Jie Tan Jian Luo Kun Meng Xianhong Lu Xi Sui Juan Dai Ping Chen Baolong Cao Baoxiang Chen Guoliang Luan Sheng |
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