| 杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 彭沙沙,童再康,黄华宏,周厚君,时剑,林二培.杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析[J].浙江林学院学报,2012,29(1):1-6. |
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| 作者姓名： | 彭沙沙 童再康 黄华宏 周厚君 时剑 林二培 |
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| 作者单位： | 浙江农林大学林业与生物技术学院,浙江临安,311300 |
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| 基金项目： | 浙江省重大科技专项（2008C02004-1）;浙江省自然科学基金资助项目（Y3090510）;浙江省林业厅资助项目（08A10） |
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| 摘 要： | 纤维素合成酶类似蛋白(CSL)作为一种重要的膜蛋白与纤维素合成酶具有相类似的蛋白结构,都含有D,D,D,QXXRW保守区.利用其他物种中的CesA基因的保守序列设计简并引物,采用反转录-聚合酶链式反应(RTPCR)结合cDNA末端快速扩增技术(RACE)成功地从杉木Cunninghamia lanceolata中扩增出一个含有完整阅读框架的cDNA序列,长度为4 150 bp,开放阅读框架为3 396 bp,编码1 132个氨基酸并含有保守的D,D,D,QXXRW天冬氨酸残基序列.应用美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库对获得的基因进行序列分析比对,发现它属于CslD基因家族,命名为ClCslD1基因.多重序列比对结果分析表明,该蛋白与来自颤杨Populus tremuloides,水稻Oryza sativa,拟南芥Arabidopsis thaliana等的同源基因相似性高达71％以上.利用生物软件对其进行生物学分析,为进一步研究其在植物纤化中的功能奠定基础.
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| 关 键 词： | 林木育种学 杉木 纤维素合成酶类似蛋白 克隆 表达 |
Cloning and bioimformatic analysis of the cellulose synthase-like protein gene, ClCslD1 from Cunninghamia lanceolata |
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| PENG Sha-sha
,
TONG Zai-kang
,
HUANG Hua-hong
,
ZHOU Hou-jun
,
SHI Jian
,
LIN Er-pei.Cloning and bioimformatic analysis of the cellulose synthase-like protein gene, ClCslD1 from Cunninghamia lanceolata[J].Journal of Zhejiang Forestry College,2012,29(1):1-6. |
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| Authors: | PENG Sha-sha TONG Zai-kang HUANG Hua-hong ZHOU Hou-jun SHI Jian LIN Er-pei |
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| Institution: | (School of Forestry and Biotechnology, Zhejiang A ＆ F University, Lin＇an 311300, Zhejiang, China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | forest tree breeding Cunninghamia lanceolata cellulose synthase-like （CSL） protein clone expression |
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