| 1株H6N5亚型禽流感病毒A/duck/Yangzhou/013/2008的全基因测序及遗传进化分析 |
| |
| 引用本文： | 顾敏,赵国,宋庆庆,刘文博,彭大新,刘秀梵.1株H6N5亚型禽流感病毒A/duck/Yangzhou/013/2008的全基因测序及遗传进化分析[J].畜牧兽医学报,2010,41(4). |
| |
| 作者姓名： | 顾敏 赵国 宋庆庆 刘文博 彭大新 刘秀梵 |
| |
| 作者单位： | 扬州大学,农业部畜禽传染病学重点开放实验室,扬州,225009 |
| |
| 基金项目： | 十一五国家支撑计划项目 |
| |
| 摘 要： | 在对华东地区家养水禽中流感病毒的带毒状况进行流行病学监测的过程中,采用常规的血清学试验和特异性RT-PCR方法,分离鉴定出1株H6N5亚型禽流感病毒A/duck/Yangzhou/013/2008(简称Dk/YZ/013/08)。为了探讨该亚型病毒在流感病毒生态分布中的作用,作者对Dk/YZ/013/08进行了全基因序列测定,并结合Gen-Bank中已收录的所有H6N5亚型病毒的基因组序列及其它参考序列进行了遗传进化分析。结果表明Dk/YZ/013/08的血凝素基因(HA)与近年中国台湾分离的鸭源毒株A/duck/Kingmen/E322/2004(H6N2)的核苷酸一致性最高(94%),推导的氨基酸剪切位点序列为"P-Q-I-E-T-R-G",为典型低致病性禽流感病毒的特征序列;神经氨酸酶基因(NA)与瑞士分离株A/mallard/Switzerland/WV4060167/2006(H3N5)的亲缘关系最近(核苷酸一致性96.9%);而碱性聚合酶2(PB2)基因则与A/duck/Zhejiang/11/2000(H5N1)的遗传距离最近,可能由H5N1亚型流感病毒提供,提示该毒株可能是一株重组病毒。
|
| 关 键 词： | 禽流感病毒 基因组 进化分析 重组 |
Genome Sequencing and Genetic Analysis of One H6N5 Subtype Avian Influenza Virus A/duck/Yangzhou/013/2008 |
| |
| GU Min,ZHAO Guo,SONG Qing-qing,LIU Wen-bo,PENG Da-xin,LIU Xiu-fan.Genome Sequencing and Genetic Analysis of One H6N5 Subtype Avian Influenza Virus A/duck/Yangzhou/013/2008[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2010,41(4). |
| |
| Authors: | GU Min ZHAO Guo SONG Qing-qing LIU Wen-bo PENG Da-xin LIU Xiu-fan |
| |
| Institution: | GU Min,ZHAO Guo,SONG Qing-qing,LIU Wen-bo,PENG Da-xin,LIU Xiu-fan(Key Laboratory of Animal Infectious Diseases,Yangzhou University,Yangzhou 225009,China) |
| |
| Abstract: | One H6N5 subtype avian influenza virus,A/duck/Yangzhou/013/2008(Dk/YZ/013/08),was isolated from aquatic birds in some live bird market in East China during our epidemiological surveillance and was identified by HA/HI test and specific RT-PCR test.To investigate the biological role of H6N5 avian influenza viruses in the influenza ecology,Dk/YZ/013/08 was subjected to genome sequencing.All the complete genome sequences of H6N5 subtype influenza viruses available in GenBank and some other reference sequences w... |
| |
| Keywords: | H6N5 avian influenza virus H6N5 genome phylogenetic analysis reassortment |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
