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马氏珠母贝Rab7基因序列特征及其与耐低温性状的关系
作者姓名:宋欣霖  杨佳雯  韩书雅  赖卓欣  王庆恒  邓岳文
作者单位:广东海洋大学水产学院 广东 湛江 524088;广东海洋大学水产学院 广东 湛江 524089;广东海洋大学水产学院 广东 湛江 524090;广东海洋大学水产学院 广东 湛江 524088;广东省珍珠科技创新中心 广东 湛江 524088;广东省海水养殖生物育种工程实验室 广东 湛江 524088;广东海洋大学水产学院 广东 湛江 524088;广东省珍珠科技创新中心 广东 湛江 524088;广东省海水养殖生物育种工程实验室 广东 湛江 524088;广东省水产动物病害防控与健康养殖重点实验室 广东 湛江 524088;广东海洋大学水产学院 广东 湛江 524088;广东省珍珠科技创新中心 广东 湛江 524088;广东省海水养殖生物育种工程实验室 广东 湛江 524088;广东省水产动物病害防控与健康养殖重点实验室 广东 湛江 524089
摘    要:Rab蛋白是膜泡运输过程中的重要调节因子,在囊泡运输和水产动物的免疫应答中行使重要功能。本研究鉴定了马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)的Rab7基因(Pm-Rab7),分析了Pm-Rab7在6个组织中及在温度胁迫(低温组17 ℃、对照组22 ℃、高温组32 ℃)下的表达模式,筛选和比较分析了马氏珠母贝耐低温选育系(low temperature resistant line, R) F3和北部湾野生群体(Beibu Gulf wild population, W)的Pm-Rab7外显子区的SNP位点。结果显示,Pm-Rab7序列全长为1 153 bp,5′端、3′端和开放阅读框(ORF)序列长度分别为30、505和618 bp,共编码205个氨基酸;Pm-Rab7具有一个RAB保守结构域,并与太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)相似度最高(92.79%)。系统进化树结果显示,Pm-Rab7与太平洋牡蛎等软体动物聚为一支。Pm-Rab7在所检测的组织都有表达,其中在性腺和鳃中的表达显著高于外套膜和肝胰腺等组织(P<0.05)。Pm-Rab7温度胁迫后时序表达分析发现,在17 ℃低温组,Pm-Rab7的表达量呈先上升再下降的趋势,在6 h~3 d内均显著高于22 ℃对照组(P<0.05),在1 d时达到峰值;在32 ℃高温组,Pm-Rab7表达量总体稳定,仅12 h时显著高于对照组(P<0.05),其他时间点与对照组无显著差异(P>0.05);说明该基因的表达与马氏珠母贝对低温胁迫的响应密切相关。Pm-Rab7基因的外显子区域在马氏珠母贝耐低温选育系和北部湾野生群体中共检测到7个SNP位点,其中3个位点的基因型频率在2个群体间具有显著性差异,说明这些位点可能与其耐低温性状相关。结果表明,Pm-Rab7可能在马氏珠母贝耐低温适应过程中发挥重要作用,研究结果可为深入探讨马氏珠母贝对温度变化的环境适应性研究提供参考资料。

关 键 词:马氏珠母贝  Pm-Rab7  基因克隆  温度胁迫  SNP
收稿时间:2022/7/13 0:00:00
修稿时间:2022/8/7 0:00:00

Sequence characteristics of Rab7 of Pinctada fucata martensii and its relationship with low temperature tolerance
Authors:SONG Xinlin  YANG Jiawen  HAN Shuy  LAI Zhuoxin  WANG Qingheng  DENG Yuewen
Institution:Fisheries College, Guangdong Ocean University, Zhanjiang 524088, China;Fisheries College, Guangdong Ocean University, Zhanjiang 524089, China;Fisheries College, Guangdong Ocean University, Zhanjiang 524090, China;Fisheries College, Guangdong Ocean University, Zhanjiang 524088, China; Guangdong Science and Innovation Center for Pearl Culture, Zhanjiang 524088, China; Guangdong Provincial Engineering Laboratory for Mariculture Organism Breeding, Zhanjiang 524088, China;Fisheries College, Guangdong Ocean University, Zhanjiang 524088, China; Guangdong Science and Innovation Center for Pearl Culture, Zhanjiang 524088, China; Guangdong Provincial Engineering Laboratory for Mariculture Organism Breeding, Zhanjiang 524088, China; Guangdong Provincial Key Laboratory of Aquatic Animal Disease Control and Healthy Culture, Zhanjiang 524088, China
Abstract:
Keywords:Pinctada fucata martensii  Pm-Rab7  Gene cloning  Temperature stress  SNP
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