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6个野鸭群体的遗传多样性及其与绍兴麻鸭的亲缘关系分析
引用本文:陶争荣,徐小钦,沈军达,李丽,曾涛,杜雪,董仕海,卢立志.6个野鸭群体的遗传多样性及其与绍兴麻鸭的亲缘关系分析[J].农业生物技术学报,2016(8):1173-1180.
作者姓名:陶争荣  徐小钦  沈军达  李丽  曾涛  杜雪  董仕海  卢立志
作者单位:1. 浙江省农业科学院畜牧兽医研究所,杭州,310021;2. 浙江省农业科学院畜牧兽医研究所,杭州310021;南京农业大学动物科技学院,南京210095;3. 浙江省农业科学院畜牧兽医研究所,杭州310021;福建省农业科学院畜牧兽医研究所,福州350013;4. 宁波奥纪农业科技有限公司,奉化,315500
基金项目:国家水禽产业技术体系(No.CARS43-2)
摘    要:为了探讨野鸭的遗传多样性和与家鸭的亲缘关系,本研究利用短串联重复序列(short tandem repeat,STR)分型技术对绿头野鸭(Anas platyrhynchos)、西湖野鸭(A.platyrhynchos)、奉化野鸭(A.platyrhynchos)、斑嘴野鸭(A.poecilorhyncha)、针尾野鸭(A.acuta)和赤嘴潜鸭(Netta rufina)6个野鸭群体(共计269只),以及家鸭品种绍兴麻鸭(A.platyrhynchos domestic)60个个体在11个位点上的遗传多样性进行了检测.结果表明,在7个群体中共检测到了141个有效等位基因(effective number of alIeles,Ne),平均有效等位基因为12.821,期望杂合度(expected heterozygosity,He)为0.856,多态信息含量(polymorplism information content,PIC)为0.845.11个位点均为中高度多态位点,适用于鸭的遗传多样性分析.7个群体的遗传多样性丰富,PIC在0.310~0.960之间.F-统计量分析显示,所有位点的Fst在0.047~0.469之间,平均为0.171,表明群体间的遗传变异较大.Nei氏遗传距离分析及系统发育树显示,绿头野鸭、西湖野鸭、奉化野鸭和绍兴麻鸭遗传距离较近,与赤嘴潜鸭、斑嘴野鸭和针尾野鸭的遗传距离较远,同时这3个群体间的遗传距离也较远,并且赤嘴潜鸭单独聚为一类.此外,绍兴麻鸭与绿头野鸭遗传距离远小于其与斑嘴野鸭的遗传距离,提示绍兴麻鸭起源于绿头野鸭的可能性更大.本研究通过对6个野鸭品种的遗传多样性及与绍兴麻鸭的亲缘关系分析,进一步完善了野鸭与家鸭的遗传结构.

关 键 词:  微卫星  遗传多样性  遗传距离

Analysis of Genetic Diversity and Relationship Among 6 Wild Duck breeds and Shaoxing Partridge Duck (Anas platyrhynchos domestic)
Abstract:
Keywords:Duck  Microsatellite  Genetic diversity  Genetic distance
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