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植物EST-SSR标记开发及其应用
引用本文:张利达,唐克轩.植物EST-SSR标记开发及其应用[J].广西农业生物科学,2010(3):534-541.
作者姓名:张利达  唐克轩
作者单位:上海交通大学农业与生物学院植物生物技术研发中心,上海200030
基金项目:上海市科委基础重大项目(09DJ1400504); 上海交通大学晨星青年学者奖励计划(0809)共同资助
摘    要:随着生物科技的进步,大量的植物表达序列标签(expressed sequence tags,ESTs)已经成为开发SSR标记的重要资源。EST-SSR作为一种新型分子标记,其多态性可能与基因功能直接相关,而且在相近植物间具有良好通用性,使得EST-SSR标记在实际应用中更具价值。采用计算机方法大规模发掘EST-SSR多态性位点极大地提高了SSR标记开发效率。尤其随着新一代测序技术的成熟以及测序成本的急剧下降,利用新一代测序技术产生大量的转录组数据进行EST-SSR多态性标记的计算机大规模发掘将对SSR标记的开发带来深远影响。本文简要介绍了植物EST-SSR分布特点,并对EST-SSR标记开发现状以及相关应用作了综合评述,此外,还对EST-SSR标记的计算机开发新策略进行了展望。

关 键 词:表达序列标签(ESTs)  简单重复序列(SSRs)  EST-SSRs

Development of Plant EST-SSR Markers and Its Application
Zhang Lida Tang Kexuan.Development of Plant EST-SSR Markers and Its Application[J].Journal of Guangxi Agricultural and Biological Science,2010(3):534-541.
Authors:Zhang Lida Tang Kexuan
Institution:Zhang Lida Tang Kexuan Plant Biotechnology Research Center,School of Agriculture and Biology,Shanghai Jiao Tong University,Shanghai,200030
Abstract:
Keywords:Expressed sequence tags(ESTs)  Simple sequence repeats(SSRs)  EST-SSRs
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