| 玉米响应渗透胁迫的数字基因表达谱分析 |
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| 引用本文： | 葛淑娟,孙爱清,刘鹏,张杰道,董树亭.玉米响应渗透胁迫的数字基因表达谱分析[J].作物学报,2014,40(7):1164-1173. |
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| 作者姓名： | 葛淑娟 孙爱清 刘鹏 张杰道 董树亭 |
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| 作者单位： | 山东农业大学生命科学学院 / 作物生物学国家重点实验室 / 山东省作物生物学重点实验室, 山东泰安 271018;
山东农业大学农学院, 山东泰安 271018 |
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| 基金项目： | 本研究由中国博士后科学基金(2012M511053)和国家转基因生物新品种培育重大专项(2013ZX08011-006)资助。 |
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| 摘 要： | 以玉米种质POB21为材料,利用数字基因表达谱技术对15%PEG渗透胁迫处理后的玉米叶片cDNA文库进行差异基因表达谱分析。结果表明,转录组基因序列与参考基因组高度一致,基因表达呈现出高度不均一性和部分冗余性。从中筛选出1097个有效差异表达基因,其中795个表达上调,302个表达下调。GO功能显著性富集分析表明,3种细胞组分和分子功能中的3种糖基转移酶活性表现为富集。KEGG代谢分析表明差异表达基因广泛涉及糖、蛋白、核酸和脂类等生物大分子代谢、次生代谢、激素代谢以及能量代谢过程。脯氨酸代谢相关基因的差异表达分析表明,谷氨酸途径是胁迫诱导脯氨酸积累的主要方式。表达谱分析结果为玉米渗透胁迫响应分子机制的深入研究和功能基因的筛选奠定了基础。
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| 关 键 词： | 玉米 渗透胁迫 基因表达谱 差异表达基因 |
| 收稿时间： | 2014-01-21 |
In silico Expression Profile of Maize Genes in Response to Osmotic Stress |
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| GE Shu-Juan,SUN Ai-Qing,LIU Peng,ZHANG Jie-Dao,DONG Shu-Ting.In silico Expression Profile of Maize Genes in Response to Osmotic Stress[J].Acta Agronomica Sinica,2014,40(7):1164-1173. |
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| Authors: | GE Shu-Juan SUN Ai-Qing LIU Peng ZHANG Jie-Dao DONG Shu-Ting |
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| Institution: | 1. State Key Laboratory of Crop Biology / Shandong Key Laboratory of Crop Biology / College of Life Sciences, Shandong Agricultural University, Tai’an 271018, China;2. College of Agriculture, Shandong Agricultural University, Tai’an 271018, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Maize Osmotic stress Gene expression profile Differentially expressed genes |
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