| 甜菜应答盐胁迫PUB基因的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王爽,李海英.甜菜应答盐胁迫PUB基因的生物信息学分析[J].中国农学通报,2021,37(33):120-127. |
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| 作者姓名： | 王爽 李海英 |
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| 作者单位： | 1.黑龙江大学农业微生物技术教育部工程研究中心,哈尔滨 150500;2.黑龙江大学生命科学学院/黑龙江省普通高校分子生物学重点实验室,哈尔滨 150080 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金“转录因子BvGT-1调控乙二醛酶I基因参与甜菜单体附加系耐盐的分子机制”(32072122);2021年黑龙江大学校级研究生创新科研项目(YLSCX2021-207HLJU) |
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| 摘 要： | 旨在为研究甜菜U-box型E3泛素连接酶提供理论基础。以甜菜T710-Mu品系为试验材料,前期通过转录组数据获得在盐胁迫下差异表达的甜菜PUB基因(plant U-box gene),利用生物信息学的方法对这些PUB基因进行分析,主要包括理化性质分析、染色体定位分析、基因序列分析、结构域分析、家族分类分析以及互作蛋白预测。结果显示甜菜PUB基因在甜菜9条染色体上均有定位,并且包含PUB蛋白具有的多个保守结构域,如U-box,Pkinase、Pkinase-Tyr、Usp、Arm以及KAP结构域,以拟南芥U-box家族分类为依据发现甜菜U-box多位于ClassⅡ、ClassⅢ、ClassⅣ中,甜菜PUB蛋白可作为E3泛素连接酶与多种功能蛋白相互作用,实现泛素化修饰。植物PUB蛋白具有E3泛素连接酶活性,在植物生长发育过程以及抵抗环境压力中起到重要作用。
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| 关 键 词： | 甜菜 盐胁迫 U-box E3泛素连接酶 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2021-05-19 |
PUB Gene in Sugar Beet Response to Salt Stress: Bioinformatics Analysis |
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| Wang Shuang,Li Haiying.PUB Gene in Sugar Beet Response to Salt Stress: Bioinformatics Analysis[J].Chinese Agricultural Science Bulletin,2021,37(33):120-127. |
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| Authors: | Wang Shuang Li Haiying |
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| Institution: | 1.Engineering Research Center of Agricultural Microbiology Technology, Ministry of Education, Heilongjiang University, Harbin 150500;2.Key Laboratory of Microbiology, College of Heilongjiang Province/School of Life Sciences, Heilongjiang University, Harbin 150080 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | sugar beet salt stress U-box ubiquitin ligase bioinformatics |
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