基于转录组数据对陆地棉GhHMP1的克隆及表达分析 |
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引用本文: | 韩明格,王晓歌,杨笑敏,王德龙,王俊娟,王帅,郭丽雪,樊伟丽,陈超,叶武威.基于转录组数据对陆地棉GhHMP1的克隆及表达分析[J].分子植物育种,2018(17). |
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作者姓名: | 韩明格 王晓歌 杨笑敏 王德龙 王俊娟 王帅 郭丽雪 樊伟丽 陈超 叶武威 |
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作者单位: | 新疆农业大学农学院;中国农业科学院棉花研究所棉花生物学国家重点实验室 |
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摘 要: | 本研究就转录组数据分析得到一个与镉胁迫相关的基因GhHMP1(Heavy metal transport/detoxification superfamily protein1),并从陆地棉耐镉品种‘邯242’中克隆成功。为研究该基因的功能和特点,对其进行生物信息学分析、转录组分析和实时荧光定量表达分析。结果表明:陆地棉‘邯242’基因GhHMP1的CDS全长为402 bp,编码133个氨基酸,分子量约为14.88 kD,等电点为8.20;转录组和实时荧光定量分析表明,GhHMP1基因的表达具有组织特异性,且受镉胁迫诱导,可以作为重要的候选基因来培育棉花耐镉新材料,从而为棉花耐镉育种及修复重金属污染土壤提供重要的理论依据。
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