| 香青菜亚麻酸含量性状相关miRNA的鉴定 |
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| 引用本文： | 王镇,刘照坤,杜奕承,陈素娟,陈国元.香青菜亚麻酸含量性状相关miRNA的鉴定[J].分子植物育种,2022(1). |
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| 作者姓名： | 王镇 刘照坤 杜奕承 陈素娟 陈国元 |
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| 作者单位： | 苏州农业职业技术学院;苏州市农业科学院 |
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| 基金项目： | 江苏省高等学校自然科学研究面上项目(18KJB210010);苏州市科技计划农业科技创新项目(SNG2017057)共同资助。 |
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| 摘 要： | 本研究旨在发掘香青菜(Brassica campestris ssp.chinensis L.Makino,NHCC)中影响亚麻酸含量的相关miRNA及其对应靶基因,探究它们的调控机制。以香青菜亚麻酸含量差异大的两个亚种‘绣花筋’和‘黑叶香青菜’的成熟叶片为材料,采用小RNA高通量测序来鉴定两个材料中差异表达的miRNA,预测其靶基因并进行基因功能注释。试验共鉴定得到miRNA 236个,包括159个已知miRNA,77个新的miRNA。筛选出差异表达的miRNA 63个,其中,以‘黑叶香青菜’为对照,上调的有28个,下调的有35个。差异表达的miRNA对应的靶基因中共6041个得到功能注释,其涉及的主要通路多个与脂肪酸代谢相关,如α-亚麻酸代谢、脂肪酸合成、不饱和脂肪酸的生物合成、脂肪酸降解等。差异表达miRNA的靶基因主要是一些亚麻酸合成或代谢重点的关键酶,如脂氧合酶(lipoxygenase,LOX)、3-酮酰基-CoA硫酶2(3-ketoacyl-CoA thiolase,KCS)等。香青菜通过对这些miRNA在不同品种中的差异表达负调控LOX等脂肪酸代谢关键基因和KCS等亚麻酸合成相关基因的表达,一方面减少亚麻酸的代谢损失,另一方面增加亚麻酸的合成量,从而引起亚麻酸含量的增高。
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| 关 键 词： | 香青菜 亚麻酸 差异表达miRNA miRNA靶基因 |
Identification of miRNA Associated with Linolenic Acid Content Traits in Brassica campestris ssp.chinensis |
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| Wang Zhen,Liu Zhaokun,Du Yicheng,Chen Sujuan,Chen Guoyuan.Identification of miRNA Associated with Linolenic Acid Content Traits in Brassica campestris ssp.chinensis[J].Molecular Plant Breeding,2022(1). |
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| Authors: | Wang Zhen Liu Zhaokun Du Yicheng Chen Sujuan Chen Guoyuan |
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| Institution: | (Suzhou Polytechnic Institute of Agriculture,Suzhou,215008;Suzhou Academy of Agricultural Sciences,Suzhou,215008) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Xiangqingcai Linolenic acid Differentially expressed miRNA miRNA target genes |
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