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陆地棉GRF基因家族的鉴定和生物信息学分析
引用本文:张书芹,乐愉,武斐.陆地棉GRF基因家族的鉴定和生物信息学分析[J].分子植物育种,2019,17(12):3817-3824.
作者姓名:张书芹  乐愉  武斐
作者单位:华中农业大学植物科学技术学院,武汉,430070;华中农业大学作物学国家级实验教学示范中心,武汉,430070;华中农业大学植物科学技术学院,武汉,430070
摘    要:为了揭示陆地棉生长调控因子(growth-regulating factors, GRF)家族的功能,本研究利用全基因组信息在陆地棉基因组中鉴定了 33个GRF蛋白,并对这些家族成员进行了保守结构域分析、蛋白的基本理化性质分析、进化分析、基因的结构分析、染色体定位、保守基序分析和组织表达模式分析。研究表明,陆地棉GRF均含有QLQ和WRC 2个保守结构域,系统进化分为4个亚家族,基因定位在19条染色体上,基因上有2~19个蛋白编码区域,大多数的基因在柱头、子房和20 d的种子中高量表达。本研究弄清了棉花GRF家族的基本信息,为进一步研究棉花GRF家族成员的功能提供了理论指导。

关 键 词:陆地棉(Gossypium  hirsutum)  生长调控因子(GRF)  生物信息学

Genome-wide Identification and Basis Characteristic Analysis of Growth-regulating Factors in Gossypium hirsutum
Zhang Shuqin,Le Yu,Wu Fei.Genome-wide Identification and Basis Characteristic Analysis of Growth-regulating Factors in Gossypium hirsutum[J].Molecular Plant Breeding,2019,17(12):3817-3824.
Authors:Zhang Shuqin  Le Yu  Wu Fei
Institution:(College of Plant Science&Technology of Huazhong Agricultural University,Wuhan,430070;National Experimental Teaching Demonstration Centre of Crop Science,Huazhong Agricultural University,Wuhan,430070)
Abstract:Zhang Shuqin;Le Yu;Wu Fei(College of Plant Science&Technology of Huazhong Agricultural University,Wuhan,430070;National Experimental Teaching Demonstration Centre of Crop Science,Huazhong Agricultural University,Wuhan,430070)
Keywords:Upland cotton (Gossypium hirsutum)  Growth-regulating factors (GRF)  Bioinformatics
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