| 全基因组关联分析定位水稻芽期中胚轴长度性状QTL |
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| 引用本文： | 瞿媛,姚威,刘雄伦,刘金灵.全基因组关联分析定位水稻芽期中胚轴长度性状QTL[J].分子植物育种,2023(3):858-865. |
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| 作者姓名： | 瞿媛 姚威 刘雄伦 刘金灵 |
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| 作者单位： | 湖南农业大学农学院国家南方粮油作物协同创新中心作物基因工程湖南省重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31972256)共同资助； |
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| 摘 要： | 直播稻出苗难的问题是制约直播稻发展的重要因素之一，中胚轴的长度与直播稻大田出苗率和出苗质量密切相关。利用控制中胚轴伸长的基因培育长中胚轴品种是提高水稻直播稻出苗率和出苗质量的重要策略。为了挖掘长中胚轴水稻品种资源和鉴定控制中胚轴长度的基因，本研究以来源广泛的203份水稻核心种质为研究材料，评价了不同类型品种芽期中胚轴长度表型变异，利用全基因组关联分析(genome wide association analysis, GWAS)定位了控制中胚轴长度的QTL，并预测相关候选基因。结果表明，不同亚群材料中胚轴长度表型变异丰富，6个亚群平均长度为AUS稻(AUS)>温带粳稻(TEJ)>中间型(ADMIX)>籼稻(IND)>热带粳稻(TRJ)>香稻(AROMATIC)。GWAS分析定位了21个中胚轴长度相关QTL，共48个显著关联的SNP(P<0.001)，分别位于第1、2、3、4、5、6和10染色体上。预测获得其中5个QTL区间的6个候选基因，编码松弛细胞壁、细胞伸长因子、生长素诱导等蛋白。研究结果为进一步克隆水稻中胚轴长度调控基因和利用分子标记辅助选择培...
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| 关 键 词： | 水稻 中胚轴长度 全基因组关联分析 数量性状位点 |
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