| 砂藓(Racomitrium canescens)RcRab基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 刘博,沙伟,周伯,马天意,柴媛媛,孙苗龙,张梅娟.砂藓(Racomitrium canescens)RcRab基因的克隆及生物信息学分析[J].分子植物育种,2020(3):898-904. |
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| 作者姓名： | 刘博 沙伟 周伯 马天意 柴媛媛 孙苗龙 张梅娟 |
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| 作者单位： | 齐齐哈尔大学生命科学与农林学院 |
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| 基金项目： | 齐齐哈尔大学大学生创新项目(201810232137);黑龙江省省属高等学校基本科研业务费科研项目(135209262);国家自然科学基金项目(31570207)共同资助。 |
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| 摘 要： | 本研究以砂藓(Racomitrium canescens)为材料,从砂藓干旱处理转录组数据库中筛选获得小G结合蛋白基因Rab的mRNA序列,通过RT-PCR法扩增,得到RcRab基因的CDS序列,并对其进行了生物信息学分析。结果表明,该基因c DNA全长为1171 bp,包含636 bp的开放阅读框,编码211个氨基酸。预测该基因有Rab家族的保守结构域-G结构域。RcRab蛋白分子质量为23.29 kD,理论等电点为5.76,具有亲水性,不属于跨膜蛋白且不存在信号肽。进化树分析表明,RcRab蛋白质与小立碗藓(Physcomitrella patens)Rab蛋白质亲缘关系最近。本研究可为进一步探索RcRab基因在苔藓植物中的抗旱机制提供数据基础。
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| 关 键 词： | 砂藓 RcRab基因 克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of RcRab in Racomitrium canescens |
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| Liu Bo,Sha Wei,Zhou Bo,Ma Tianyi,Chai Yuanyuan,Sun Miaolong,Zhang Meijuan.Cloning and Bioinformatics Analysis of RcRab in Racomitrium canescens[J].Molecular Plant Breeding,2020(3):898-904. |
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| Authors: | Liu Bo Sha Wei Zhou Bo Ma Tianyi Chai Yuanyuan Sun Miaolong Zhang Meijuan |
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| Institution: | (Key Laboratory of Resistance Gene Engineering and Presevation of Biodiversity in Cold Areas,College of Life Sciences and Agriculure and Forestry,Qiqihar University,Qiqihar,161006) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Racomitrium canescens RcRab gene Cloning Bioinformatics analysis |
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