PEG胁迫下玉米转录组差异性分析 |
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引用本文: | 赵志军,刘延波,李海登,王一菲,刘润雨,潘春梅,孙西玉.PEG胁迫下玉米转录组差异性分析[J].种子,2020(2):44-49. |
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作者姓名: | 赵志军 刘延波 李海登 王一菲 刘润雨 潘春梅 孙西玉 |
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作者单位: | 河南牧业经济学院食品与生物工程学院(酒业学院);河南牧业经济学院河南省白酒风格工程技术研究中心;河南牧业经济学院郑州市白酒酿造微生物技术重点实验室;张弓老酒酒业有限公司 |
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基金项目: | 河南省高等学校重点科研项目[17 A 180005];河南省重大科技专项[181100211400-4];河南牧业经济学院博士科研启动资金项目;河南牧业经济学院青年科研创新基金项目[XKYCXJJ 2017015];河南牧业经济学院重点培育学科建设项目;河南牧业经济学院大学生创新重点项目;国家级大学生创新创业训练计划项目[201610469019] |
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摘 要: | 为了明确玉米响应PEG胁迫的关键表达基因,比较PEG胁迫下玉米基因表达的差异,本实验利用RNA-seq对正常灌溉和干旱胁迫的玉米进行转录本测序和数据分析,共获得12358个差异表达基因,其中5275个基因为上调表达,7083个基因为下调表达。对差异表达基因进行COG功能分类,共得到23个不同的COG功能,其中翻译后修饰,蛋白质转换,伴随蛋白681个,占7.74%;信号传导机制功能有转录本675个,占7.67%;转录506个,占5.75%。KEGG通路显著富集到光合作用-天线蛋白、光合生物的固碳作用、卟啉和叶绿素代谢、脂肪酸降解、精氨酸和脯氨酸代谢、磷酸肌醇信号等生命代谢途径。
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关 键 词: | RNA-SEQ 玉米 PEG胁迫 差异表达 代谢通路 |
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