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马铃薯StPR1基因克隆及表达特异性分析
引用本文:李秀钰,贺付蒙,韩瑛琪,赵潇璨,武佳文,朱元芳,周磊,石奇海,冯哲,李凤兰.马铃薯StPR1基因克隆及表达特异性分析[J].华北农学报,2019,34(2).
作者姓名:李秀钰  贺付蒙  韩瑛琪  赵潇璨  武佳文  朱元芳  周磊  石奇海  冯哲  李凤兰
作者单位:东北农业大学 生命科学学院,黑龙江 哈尔滨,150030;东北农业大学 生命科学学院,黑龙江 哈尔滨,150030;东北农业大学 生命科学学院,黑龙江 哈尔滨,150030;东北农业大学 生命科学学院,黑龙江 哈尔滨,150030;东北农业大学 生命科学学院,黑龙江 哈尔滨,150030;东北农业大学 生命科学学院,黑龙江 哈尔滨,150030;东北农业大学 生命科学学院,黑龙江 哈尔滨,150030;东北农业大学 生命科学学院,黑龙江 哈尔滨,150030;东北农业大学 生命科学学院,黑龙江 哈尔滨,150030;东北农业大学 生命科学学院,黑龙江 哈尔滨,150030
基金项目:国家自然科学基金;国家自然科学基金;哈尔滨市应用科技研究与开发项目
摘    要:为了探究病程相关蛋白(Pathogenesis related protein,PR蛋白)与马铃薯抗病的相关性,检验其在马铃薯中抗软腐病、青枯病、干腐病的能力。在前期的马铃薯抗病性研究中对PRs的17个家族基因结合转录组数据进行分析及基因的筛选,最终确定PR1为试验的研究对象。选用马铃薯大西洋品种为材料,由黑龙江省农科院提供,主要进行StPR1基因的克隆,并对其进行生物信息学分析;将真菌接骨木镰孢、燕麦镰孢以及导致软腐病和青枯病等细菌为胡萝卜软腐欧文氏菌、菊欧氏菌、胡萝卜软腐欧文氏菌马铃薯黑胫亚种、茄科雷尔氏菌接种到马铃薯块茎后进行StPR1基因表达特异性分析。结果显示,StPR1基因长度为540 bp,编码179个氨基酸,蛋白质疏水性及亲水性预测PR1蛋白序列的GRAVY值在+4~-3之间,含有亲水区及疏水区,蛋白质二级结构预测其属于混合型蛋白,蛋白质三级结构预测发现其为紧密复杂的螺旋结构,具有SCP_PR-1_like保守结构域,其与辣椒PR1基因在一个进化分支上,相似性较高。qRT-PCR结果显示,StPR1基因的表达量表现为抗真菌胁迫高于细菌胁迫,并预测其抗干腐病的能力强于抗软腐病及青枯病的能力。综上所述,当马铃薯受到外界病原菌侵害时,StPR1在马铃薯的抗病过程中发挥着重要的作用。

关 键 词:马铃薯  StPR1  基因克隆  表达特异性  抗病
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