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| 类猪圆环病毒因子P1 VP2蛋白二级结构与B细胞表位预测 | |
| 引用本文： | 温立斌,何孔旺,杨汉春,王玉然.类猪圆环病毒因子P1 VP2蛋白二级结构与B细胞表位预测[J].华北农学报,2009,24(5). |
| 作者姓名： | 温立斌 何孔旺 杨汉春 王玉然 |
| 作者单位： | 1. 江苏省农业科学院,兽医研究所,农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室,国家兽用生物制品工程技术研究中心,江苏,南京,210014 2. 中国农业大学,动物医学院,农业部预防兽医学重点开放实验室,北京,100094 3. 河北省动物卫生监督所,河北,石家庄,050081 |
| 基金项目： | 国家"973"计划前期研究专项，江苏省自然科学基金 |
| 摘 要： | 旨为预测类猪圆环病毒因子P1 VP2蛋白的B细胞表位.采用生物信息软件和互联网服务器,预测VP2的二级结构,分析VP2表面特性(亲水性、可塑性、可及性和抗原性),综合预测VP2的B细胞抗原表位.结果表明,P1 VP2蛋白肽链的6-18和80-92区段为预测的B细胞表位优势区.多参数方案综合预测P1 VP2蛋白的B细胞抗原表位,为进一步鉴定表位及设计疫苗奠定了基础. |
| 关 键 词： | 二级结构 B细胞表位 生物信息学 预测 |
Prediction of Secondary Structure and B Cell Epitope for VP2 Protein of Porcine Circovirus-like Agent P1 |
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| WEN Li-bin,HE Kong-wang,YANG Han-chun,WANG Yu-ran.Prediction of Secondary Structure and B Cell Epitope for VP2 Protein of Porcine Circovirus-like Agent P1[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2009,24(5). | |
| Authors: | WEN Li-bin HE Kong-wang YANG Han-chun WANG Yu-ran |
| Abstract: | To predict the B cell epitopes for VP2 protein of porcine circovirus-like agent PI. By using biotic soft-wares and network servers,the secondary structure of VP2 was predicted,and the surface properties (hydrophilicity,flexi-bility ,accessibility and antigenicity) of VP2 were analysed.Then the B cell epitopes integrated prediction were obtained. The predominant B cell epitopes predicted were probably in the region of 6 - 18 and 80 - 92.The results of B cell epi-topes prediction using multiple parameters are helpful for further epitopes identification and vaccine design of P1. |
| Keywords: | P1 |
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