犬链球菌M蛋白基因的克隆及生物信息学分析 |
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引用本文: | 梁昱,刘燕霏,孙晓莉,杨建德.犬链球菌M蛋白基因的克隆及生物信息学分析[J].天津农学院学报,2018(1). |
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作者姓名: | 梁昱 刘燕霏 孙晓莉 杨建德 |
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作者单位: | 天津农学院动物科学与动物医学学院 |
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摘 要: | 本研究对犬链球菌M蛋白(SCM)基因克隆,并对其进行生物信息学分析,预测其蛋白质结构及功能,为链球菌表位疫苗的研究及链球菌病的诊断提供参考。利用ExPASy ProtParam在线分析软件,预测犬链球菌M蛋白为亲水性蛋白质且属于稳定蛋白。使用SignalP 4.1软件推测该蛋白有信号肽。利用SOPMA中5种相互独立的方法预测其二级结构,其中α螺旋占83.53%,可知α螺旋为二级结构的主要元件。应用SWISS-MODEL在线分析软件,进行三级构造同源建模,发现其结果与二级结构预测结论大致相同。使用DNAStar预测软件中的Protean部分对SCM亲水性、蛋白质的二级结构、抗原性指数、表面可能性、柔韧性进行归纳比较分析,在第55~59和第377~379氨基酸区段存在B细胞表位。
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