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云南切梢小蠹热激蛋白20基因克隆及序列分析
引用本文:杨诚,许玉,刘霞.云南切梢小蠹热激蛋白20基因克隆及序列分析[J].南方农业学报,2018,49(12):2425-2431.
作者姓名:杨诚  许玉  刘霞
作者单位:西南林业大学 生物多样性保护与利用学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室,昆明,650224
摘    要:目的]对云南切梢小蠹(Tomicus yunnanensis)成虫热激蛋白20基因(TynHSP20)进行克隆和序列分析,为研究该虫在高温环境下的抗逆机制打下基础.方法]采用cDNA末端快速扩增技术(Rapid amplification of cDNA ends,RACE)克隆云南切梢小蠹成虫TynHSP20基因cDNA序列,并对其序列进行生物信息学分析.结果]克隆获得的TynHSP20基因cDNA序列长671 bp,含开放阅读框597 bp,5'端非编码序列和部分3'端非编码序列分别为44和33 bp.该基因编码198个氨基酸,预测蛋白质分子量为22.50 kD,等电点为7.86,包含一个保守的α-晶体蛋白结构域.同源性比对分析结果表明,TynHSP20蛋白氨基酸序列与东亚飞蝗、蓼蓝齿胫叶甲、斜纹夜蛾和美洲斑潜蝇的HSP20氨基酸序列相似性均低于20%.系统发育分析结果显示,TynHSP20与沙葱萤叶甲的亲缘关系较近.结论]成功克隆获得TynHSP20基因cDNA序列,该基因具有小热激蛋白家族的特征,但与其他物种小热激蛋白的同源性较低.

关 键 词:云南切梢小蠹    HSP20基因    基因克隆    序列分析    系统发育进化树

Cloning and sequence analysis of heat shock protein 20 gene (TynHSP20)from Tomicus yunnanensis(Coleoptera:Scolytidae)
YANG Cheng,XU Yu,LIU Xia.Cloning and sequence analysis of heat shock protein 20 gene (TynHSP20)from Tomicus yunnanensis(Coleoptera:Scolytidae)[J].Journal of Southern Agriculture,2018,49(12):2425-2431.
Authors:YANG Cheng  XU Yu  LIU Xia
Abstract:
Keywords:
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